CRSPR/Cas9新对手——“咪咪病毒”

近日,科学家捣腾巨病毒时发现了一种类似于CRISPR-Cas9的潜在基因编辑系统。

1咪咪/米米病毒

mimi病毒寄生在阿米巴变形虫中,是病毒界的泰坦,直径可达800nm。举个栗子,假如姚明是人类中的巨人,那mimi病毒在病毒界得有4个姚明这么高。

一般来说,病毒的体积小,结构简单。学过病毒学的应该都清楚,一个病毒囊膜、核衣壳、基因组,也就差不多了。除此之外,病毒的基因组不管是RNA还是DNA,不管是双链还是单股正链还是单股负链,还是咋地,走的都是“短小精悍”的路线。

mimi病毒不知道是不是进化路上走岔气了,体积大就算了,基因组还异常复杂!根据新绘制的基因图谱,mimi病毒DNA包含1260个基因。细菌中的遗传巨无霸大肠杆菌不过就4000多个!再举个栗子,这就相当于给个凤凰牌装个法拉利引擎,还得是12缸的。这个调性大家可以感受一下。

2存在即合理

咪咪病毒遗传信息如此复杂,它要这么多遗传物质干嘛呢?事实上,像细菌会被噬菌体侵入,咪咪病毒因为个头大,同样也会被病毒界的一种噬病毒体(virophage)侵入。它需要编码一个“免疫系统”。

噬菌体是个啥XX玩意儿大家都清楚。CRISPR/Cas9就是细菌的安全套,它将噬菌体乱入的外源遗传信息,统统咔咔掉。它通过将乱入的外源DNA中的小片段整合到CRISPR系统中,转录相应的CRISPR RNAs作为导航,利用Cas酶,对相应的同源序列进行定点切割。

之前报导中指出,噬病毒体Zamilon只能感染B型和C型咪咪病毒,而不能感染A型咪咪病毒。研究人员推测,咪咪病毒中很可能也存在和CRISPR/Cas9功能一致的系统。

3新的基因编辑神器?

CRISPR/Cas9系统发挥功能的关键是将外源DNA整合到CRISPR系统中,使得细菌能够通过CRISPR系统识别外源DNA做出反应。假设咪咪病毒中也存在一样的系统,那应该也存在一样的行为。

研究人员发现,在A型咪咪病毒遗传信息中存在一段独特的序列(15碱基四次重复序列)。这个序列即“序列识别序列”。和CRISPR系统中将这种序列包含在CRISPR序列矩阵中不同,咪咪病毒里这段序列是编码于散在的开放式阅读框中。

但是,在分析这段独特序列周边的遗传环境时研究人员发现,在这段序列的周围存在一些编码蛋白,和CRISPR/Cas系统非常相似,这些蛋白很有可能起到核酸切割等核酸免疫功能。

不得不说这伙人还很有商业头脑,率先给这个系统起了个名字,叫“MIMIVIRE”。

说实话,CRISPR走了20年,MIMIVIRE目前只是发现验证阶段,到开发成真实可用的工具估计少说也得有个5-10年。但这段时间,它的任何研究都值得我们关注。这个研究的意义不在于发现了新的系统,这是模仿。意义在于这项发现背后的应用价值,是否比CRISPR更好用,就像当年CRISPR吊打TALEN一样。

2016-06-15