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Pepbox使用说明

多肽序列输入框中不需要包含N端和C端修饰,不然结果可能有误。

多肽序列请输入氨基酸单字母缩写,对于非常见氨基酸或者修饰性氨基酸,请使用三字母的缩写并用大括号{}括起。比如:D-苯丙氨酸写成{D-Phe}、磷酸化的丝氨酸{pSer}、磷酸化的D-丝氨酸{D-pSer}、甲基化的精氨酸{Arg(Me)}、甲基化的赖氨酸{Lys(Me)}、双甲基化的赖氨酸{Lys(Me2)}、三甲基化的赖氨酸{Lys(Me3)}等

如果Pepbox没能给出您想要的结果,请联系我们进行询价

建议纯度请参照:多肽纯度建议表

如果您需要的修饰不在列表中,请联系我们.

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一些复杂多肽的实际报价可能会比计算器的价格高,比如富含半胱氨酸或者疏水性氨基酸的多肽。


多肽性质在线计算器工具

多肽计算器

多肽标记和修饰

目前多肽标记及修饰的内容非常多,广泛应用在多肽药物,多肽生物学,多肽抗体以及多肽试剂的研究中。目前应用广泛的有:非放射性核素标记(C13,H2,N15),荧光标记(FAM,FITC等),生物素标记,磷酸化修饰等。

1. 非放射性核素标记

目前在非放射性核素标记中,使用广泛的仍然是C13,H2,因为其使用安全,放射性小。现在有比较完全的非放射性标记的氨基酸,可以按照正常的多肽合成方法将标记好的氨基酸直接连接到多肽上。

2. 荧光标记

荧光标记由于没有放射性,实验操作简单。因此,目前在生物学研究中荧光标记应用非常广泛,荧光标记方法与荧光试剂的结构有关系,对于有游离羧基的采用的方法与接肽反应相同,也采用HBTU/HOBt/DIEA方法连接。 在N端标记FITC的多肽需经历环化作用来形成荧光素,通常会伴有最后一个氨基酸的去除,但当有一个间隔器如氨基己酸,或者是通过非酸性环境将目的肽从树脂上切下来时,这种情况可避免。

3. 生物素标记

生物素-亲合素系统 (biotin-avidin system,BAS),是70年代后期应用于免疫学,并得到迅速发展的一种新型生物反应放大系统。由于它具有生物素与亲合素之间高度亲和力及多级放大效应,并与荧光素、酶、同位素等免疫标记技术有机地结合,使各种示踪免疫分析的特异性和灵敏度进一步提高。主要有用于标记多肽氨基的生物素N-羟基丁二酰亚胺酯(BNHS)和生物素对硝基酚酯(pBNP),其中以BNHS最常用,当然,也可以直接使用生物素也可以标记,因为其结构上有个游离的羧基,采用HBTU/HOBt/DIEA方法缩合,由于生物素的溶解度低,使用DMSO/DMF的混合溶剂增加溶解度。

4. 磷酸肽合成

磷酸肽在生命过程中发挥重要作用,磷酸化的位置在多肽上的Ser,Thr,Tyr。目前磷酸肽合成一般都采用磷酸化氨基酸,目前使用的都是单苄基磷酸化氨基酸。磷酸化氨基酸的连接一般采用HBTU/HOBt/DIEA方法,但是目前采用该方法合成磷酸化也有缺点,特别是在合成多磷酸化多肽或长肽的时候,连接效率低,最后产品纯度很低,对于这种磷酸化多肽,我们考虑采用后磷酸化方法,其合成过程就是在多肽合成结束后,选择性脱去要标记的氨基酸的侧链保护基,对于Tyr,Thr可以直接使用侧链不保护的氨基酸进行反应,而Ser可以采用Fmoc-Ser(trt),在1% TFA/DCM条件下可以定量的脱除。后磷酸化,采用双苄基亚磷酰胺,四氮唑生成亚磷酰胺四唑活性中间体,连接到羟基上,随后在过氧酸下氧化生成磷酰基,完成反应。

常用修饰和标记

N端标记或修饰

  • N端乙酰化(AC)
  • N端生物素标记(Biotin)
  • N端脂肪酸修饰(Pal, Myr)
  • N端罗丹明标记(Rodamine B)
  • N-FITC
  • N-5-FAM
  • N-BODIPY FL
  • N-Merocyanine 540
  • HYNIC

C端标记或修饰

  • C端酰胺化
  • C-端生物素标记 (用赖氨酸侧链连接)
  • C-FITC (用赖氨酸侧链连接)
  • C-AMC
  • C-AFC

磷酸化标记

  • p-Tyr
  • p-Ser
  • p-Thr

环化

  • 二硫键环肽(S-S)
  • 多肽首尾酰胺环

多肽蛋白偶联

  • KLH偶联
  • BSA偶联

含特殊氨基酸

  • D-amino acids
  • Cit,Aib,Abu,Ahx
  • Lys(Ac)
  • Lys(Me), Lys(Me2), Lys(Me3)

MAP 复合抗原肽

  • MAP4 4分支
  • MAP8 8分支
  • MAP16 16分支