噬菌体（英语：bacteriophage或者phage）是病毒的一种，其特别之处是专以细菌为宿主，较为熟知的噬菌体是以大肠杆菌为寄主的T2噬菌体。
跟别的病毒一样，噬菌体只是一团由蛋白质外壳包裹的遗传物质，大部分噬菌体还长有“尾巴”，用来将遗传物质注入宿主体内。超过95%已知的噬菌体以双螺旋结构的DNA为遗传物质，长度由5,000个碱基对到5,000,000个碱基对不等；余下的5%以RNA为遗传物质。噬菌体的基因组有单链DNA、双链DNA和RNA这三种类型；有线性、环状两种形式。
噬菌体是一种普遍存在的生物体，而且经常都伴随着细菌。通常在一些充满细菌群落的地方，如：泥土、动物的内脏里，都可以找到噬菌体的踪影。目前世上蕴含最丰富噬菌体的地方就是海水。在海平面，平均每毫升的海水即含有9×108个病毒粒子（virions），并使海水中70%的细菌受到噬菌体的感染。
在苏联、中欧和法国，噬菌体都曾用作抗生素的替代品，作为医疗用品的时间超过90年。。噬菌体治疗已经被更多国家的医师接受，它们被看作是对于许多细菌的多重耐药性菌株可能的治疗。
噬菌体很小，在光学显微镜下看不见，需用电子显微镜观察。不同的噬菌体在电子显微镜下有三种形态，即蝌蚪形、微球形和丝形。大多数噬菌体呈蝌蚪形，由头部和尾部两部分组成。例如大肠杆菌T4噬菌体头部呈六边形，立体对称，大小约95×65nm，内含遗传物质核酸；尾部是一管状结构，长95～125nm，直径13～20nm，由一个内径约2.5nm中空的尾髓和外面包着的尾鞘组成。尾髓具有收缩功能，可使头部核酸注入宿主菌。在头、尾连接处有一尾领结构，可能与头部装配有关。尾部末端有尾板、尾刺和尾丝，尾板内有裂解宿主菌细胞壁的溶菌酶；尾丝为噬菌体的吸附器官，能识别宿主菌体表面的特殊受体。有的噬菌体尾部很短或缺失。
a、b、c分别为T4噬菌体、λ、M13噬菌体的示意图
大多数噬菌体以裂解细胞的方式被释放至胞外，溶菌酶水解细胞壁，脂肪酶水解细胞膜，细胞裂解，释放子代噬菌体粒子（即病毒粒子）。丝状噬菌体则以分泌方式从受染细胞中释放出来，它不裂解和杀死宿主细胞，不妨碍宿主细胞，但宿主细胞的生长速度却大大降低。凡在宿主细胞内能够完成增殖过程，产生并释放大量子代噬菌体，此类噬菌体被称为烈性噬菌体（virulent phage），比如T系噬菌体（T1-T7噬菌体的总称）；温和噬菌体（比如λ噬菌体、M13噬菌体、P1噬菌体）在吸附和侵入宿主细胞后，将噬菌体基因组整合在宿主细胞DNA上（或以质粒形式储存在细胞内），随宿主DNA复制而同步复制，随宿主细胞分裂而传递到两个子细胞中，宿主细胞可正常繁殖，以上过程称为“溶源周期”。但在一定条件下，噬菌体基因组可进行复制，产生并释放子代噬菌体，即“裂解周期”。因此温和噬菌体既能进行溶源循环，还能进行裂解循环。
噬菌体与细菌侵染的关系
吸附是噬菌体与细菌表面受体发生特异性结合的过程，其特异性取决于噬菌体蛋白与宿主菌表面受体分子结构的互补性。不同噬菌体的吸附方式不同，丝形噬菌体以其末端吸附，有尾噬菌体以尾丝、尾刺吸附。丝形噬菌体如M13、f1等及微球形噬菌体如MS2等是吸附于细菌的性菌毛上，所以只感染有性菌毛的F+菌。只要细菌具有特异性受体，不论是活或已死亡，噬菌体都能吸附，但噬菌体不能进入死亡的宿主菌。所以基于M13噬菌体的噬菌体展示库要选择TG1这样的菌株做为宿主菌。
T3、T4和T7等噬菌体，其细胞受体是脂多糖，T2和T6噬菌体的受体是脂蛋白，枯草杆菌噬菌体SP-50的受体是磷酸壁。
Souce: 纽普生物 2016-09-08