纽普生物

蛋白质motif分析

模体Motif(基序),指DNA或蛋白质序列中局部的保守区域,或者是一组序列中共有的一小段序列模式,在生物学中是一个基于数据的数学统计模型。可以根据蛋白质序列特征(比如基于蛋白质基序)进行功能预测。具有相同基序或结构域的蛋白质可归为一大类,叫超家族(super family)。蛋白domains:是一种结构实体,通常代表蛋白质结构中独立折叠和行驶功能的一部分。因此,蛋白质经常是这些结构域的不同的组合构建起来的。在motif的层次上,主要是强调结构的概念而不是功能,而domain 比较强调的是功能单位,因此多半是以功能做为称呼domain的名字。如果某蛋白质具有一个 Ca+2-binding domain,那表示该蛋白质某个domain的主要功能是结合Ca+2,该domian中想必具有Ca+2-binding motif (E-F hand motif)是提供Ca+2结合用的。

1. 蛋白质序列:

全长:0



说明

以1300多个motif对输入的序列进行扫描,尽可能的发现蛋白所包含的motif

参考文献

  • Hulo N, Bairoch A, Bulliard V, et al. The PROSITE database. Nucleic Acids Res. 2006;34(Database issue):D227-D230. doi:10.1093/nar/gkj063