纽普生物

多肽库设计

多肽库设计工具,可以一键设计丙氨酸筛查库(Alanine Scanning Library)、重叠肽库(Overlapping Peptide Library)、截头肽库(Truncation Library)、位点扫描库(Positional Scanning Library)、随机肽库(Random Library)、杂乱肽库(Scrambled Library)及T细胞截头肽库(T cell truncated Library)

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多肽库

重叠多肽库(Overlapping Peptide Library) – 该工具允许您生成重叠的肽段,以覆盖您感兴趣的蛋白质的全长。您可以定义序列参数,如肽段长度和氨基酸偏移数。设计的序列可以被编辑并导出为word或Excel格式。

丙氨酸筛查库(Alanine Scanning Library) – 这个工具可以让您系统地用丙氨酸替代您的肽序列上的每个氨基酸位置,丙氨酸是天然存在的氨基酸中最小的一种,它可以保持其手性。丙氨酸筛查库可以成为探究单个氨基酸侧链对蛋白质功能和特性影响的有力工具。

截头肽库(Truncation Library) – 这个工具可以让您通过系统地去除侧翼氨基酸来建立您的肽库,以确定最佳活性所需的最小长度。一旦通过丙氨酸扫描确定了蛋白质活性所需的基本氨基酸残基,就可以围绕这些残基选择截断方向,而不是从肽序列的两端去除残基。

位点扫描库(Positional Scanning Library) – 在目的位点上替换全部的天然氨基酸,每条多肽替换一次,可用来鉴别活性最佳的多肽序列。 常用在复杂的蛋白混合物中鉴定T细胞抗原表位,或用相互依赖的子位点来定位底物,以减少合成和筛选工作量。替换可以在一个肽序列的单个或多个位置上进行。利用位置扫描构建的肽库,无论是在表位图谱还是在蛋白质-蛋白质相互作用方面,对研究蛋白质界面都有很大的参考价值。

随机肽库(Random Library) - 这个工具可以让你创建一个类似于位置扫描库的库。它是通过在原始肽上随机地替换选定的位置,并同时与所有其他天然氨基酸一起以"散弹枪"的方式构建的,目的是为了阐明潜在的替代品,以增强肽的活性。

杂乱肽库(Scrambled Library) - 杂乱肽库是通过对原始多肽序列进行排列组合来构建的。它有可能提供所有可能的备选方案,是可变性最高的肽库,可用于蛋白、抗体、基因等的靶向分子探针。杂乱肽库可用作阴性对照。

T细胞截头肽库(T cell truncated Library) - 针对目的蛋白设计T细胞相关抗原肽,将多肽逐步从两端截取为短肽,形成肽库,后将肽库混合成肽池,用以筛选T细胞最佳表位。T细胞截头肽库为筛选T细胞最佳表位提供了强有力的保证。