我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来,主要是为了方便研究工作,其中一小部分质粒进行了质量控制,可供科学家使用。
所有的产品都严格仅供科学研究使用,不能应用于临床试验,包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。
确保质粒的关键元件正确,但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列,可能与测序结果不一致,请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序,本页面一般会提供下载)
开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%,则将其视为正确。
由于科学研究是在探索未知,具有很大的不确定性,在任何情况下,我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。
- 载体名称:
- pSH179
- 载体抗性:
- Kanamycin
- 载体长度:
- 9436 bp
- 载体类型:
- Cloning vector
- 复制子:
- pSa ori
- 载体来源:
- Hiekel SSH., Budhagatapalli NNB.
- 启动子:
- CaMV35S(enhanced)
pSH179 载体图谱
质粒操作方法
1. 发货形式:质粒干粉(常温运输,存于-20度,请务必先转化提质粒后使用)
2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min,再加入20μl ddH2O溶解质粒;(质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大,这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致,因此建议先转化提质粒后再使用)
3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min,加入2μl质粒,再冰浴30min后,42℃热激60s,不要搅动,再冰浴2min;
4. 加入900μl无抗的LB液体培养基,180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);
5. 6000rpm离心5min,仅留100μl上清液重悬细菌沉淀,并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;
6. 将平板倒置37℃培养14h,如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化;没有菌落则加入10μl质粒转化;建议不要直接转表达感受态, 要先转克隆感受态,重提质粒后再导入表达感受态);
7. 挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220rpm震荡培养14h,根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
pSH179 载体序列
LOCUS 62056_19680 9436 bp DNA circular SYN 31-AUG-2021 DEFINITION Cloning vector pSH179, complete sequence. ACCESSION MT670352 VERSION . KEYWORDS . SOURCE synthetic DNA construct ORGANISM synthetic DNA construct REFERENCE 1 (bases 1 to 9436) AUTHORS Hiekel SSH., Budhagatapalli NNB. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (25-JUN-2020) Physiology and Cell Biology/Plant Reproductive Biology, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Corrensstrasse 3, Gatersleben, Saxony-Anhalt 06466, Germany REFERENCE 2 (bases 1 to 9436) AUTHORS . TITLE Direct Submission COMMENT SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: "Submitted (25-JUN-2020) Physiology and Cell Biology/Plant Reproductive Biology, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Corrensstrasse 3, Gatersleben, Saxony-Anhalt 06466, Germany" COMMENT ##Assembly-Data-START## Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 1..9436 /mol_type="other DNA" /organism="synthetic DNA construct" misc_feature complement(1..25) /label=RB T-DNA repeat /note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA" regulatory 126..488 /label=TaU6p /note="TaU6p" /regulatory_class="promoter" misc_RNA 510..585 /label=gRNA scaffold /note="guide RNA scaffold for the Streptococcus pyogenes CRISPR/Cas9 system" misc_feature 586..592 /label=poly-T signal /note="poly-T signal" promoter 710..1385 /label=CaMV 35S promoter (enhanced) /note="cauliflower mosaic virus 35S promoter with a duplicated enhancer region" CDS 1561..5661 /label=Cas9 /note="Cas9 (Csn1) endonuclease from the Streptococcus pyogenes Type II CRISPR/Cas system" terminator 5754..6006 /label=NOS terminator /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal" primer_bind complement(6015..6031) /label=M13 fwd /note="common sequencing primer, one of multiple similar variants" polyA_signal 6170..6344 /label=CaMV poly(A) signal /note="cauliflower mosaic virus polyadenylation signal" misc_feature complement(6494..6518) /label=LB T-DNA repeat /note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA" terminator complement(6797..6824) /label=rrnB T2 terminator /note="transcription terminator T2 from the E. coli rrnB gene" terminator complement(6916..7002) /label=rrnB T1 terminator /note="transcription terminator T1 from the E. coli rrnB gene" rep_origin complement(7171..7606) /direction=LEFT /label=pSa ori /note="origin of replication from bacterial plasmid pSa" rep_origin complement(7721..8309) /direction=LEFT /label=ori /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of replication" CDS complement(8402..9208) /label=KanR /note="aminoglycoside phosphotransferase"