我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来,主要是为了方便研究工作,其中一小部分质粒进行了质量控制,可供科学家使用。

所有的产品都严格仅供科学研究使用,不能应用于临床试验,包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。

确保质粒的关键元件正确,但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列,可能与测序结果不一致,请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序,本页面一般会提供下载)

开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%,则将其视为正确。

由于科学研究是在探索未知,具有很大的不确定性,在任何情况下,我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。

pegRNA 1 plasmid used for PASSIGE-mediated Bxb1 attP installation

载体名称:
AAVS1 pegRNA1 with trimmed attP
载体抗性:
Ampicillin
载体长度:
2368 bp
载体类型:
CRISPR Plasmids
载体来源:
David Liu
拷贝数:
High copy number
启动子:
U6
感受态:
TOP10
培养温度:
37℃

AAVS1 pegRNA1 with trimmed attP 载体图谱

AAVS1 pegRNA1 with trimmed attP2368 bp60012001800pBR322ori-FgRNA scaffoldU6 promoterAmpR promoterAmpR

质粒操作方法

1. 发货形式:质粒干粉(常温运输,存于-20度,请务必先转化提质粒后使用)

2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min,再加入20μl ddH2O溶解质粒;(质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大,这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致,因此建议先转化提质粒后再使用)

3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min,加入2μl质粒,再冰浴30min后,42℃热激60s,不要搅动,再冰浴2min;

4. 加入900μl无抗的LB液体培养基,180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);

5. 6000rpm离心5min,仅留100μl上清液重悬细菌沉淀,并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;

6. 将平板倒置37℃培养14h,如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化;没有菌落则加入10μl质粒转化;建议不要直接转表达感受态, 要先转克隆感受态,重提质粒后再导入表达感受态);

7. 挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220rpm震荡培养14h,根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。

AAVS1 pegRNA1 with trimmed attP 载体序列

LOCUS       Exported                2368 bp DNA     circular SYN 06-SEP-2024
DEFINITION  pegRNA 1 plasmid used for PASSIGE-mediated Bxb1 attP installation.
ACCESSION   .
VERSION     .
KEYWORDS    AAVS1 pegRNA1 with trimmed attP
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
REFERENCE   1  (bases 1 to 2368)
  AUTHORS   Pandey S, Gao XD, Krasnow NA, McElroy A, Tao YA, Duby JE, Steinbeck 
            BJ, McCreary J, Pierce SE, Tolar J, Meissner TB, Chaikof EL, Osborn 
            MJ, Liu DR
  TITLE     Efficient site-specific integration of large genes in mammalian 
            cells via continuously evolved recombinases and prime editing.
  JOURNAL   Nat Biomed Eng. 2024 Jun 10. doi: 10.1038/s41551-024-01227-1.
  PUBMED    38858586
REFERENCE   2  (bases 1 to 2368)
  AUTHORS   .
  TITLE     Direct Submission
COMMENT     SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: "Nat Biomed 
            Eng. 2024 Jun 10. doi: 10.1038/s41551-024-01227-1."
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..2368
                     /mol_type="other DNA"
                     /organism="synthetic DNA construct"
     primer_bind     340..359
                     /label=pBR322ori-F
                     /note="pBR322 origin, forward primer"
     misc_RNA        complement(632..707)
                     /label=gRNA scaffold
                     /note="guide RNA scaffold for the Streptococcus pyogenes 
                     CRISPR/Cas9 system"
     promoter        complement(728..976)
                     /label=U6 promoter
                     /note="RNA polymerase III promoter for human U6 snRNA 
                     (Domitrovich & Kunkel, 2003)"
     primer_bind     complement(786..805)
                     /label=LKO.1 5'
                     /note="Human U6 promoter, forward primer"
     primer_bind     complement(956..976)
                     /label=hU6-F
                     /note="Human U6 promoter, forward primer"
     promoter        1083..1187
                     /gene="bla"
                     /label=AmpR promoter
     CDS             1188..2048
                     /codon_start=1
                     /gene="bla"
                     /product="beta-lactamase"
                     /label=AmpR
                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                     related antibiotics"
                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                     EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                     LIKHW"
     primer_bind     complement(1406..1425)
                     /label=Amp-R
                     /note="Ampicillin resistance gene, reverse primer"
     rep_origin      join(2219..2368,1..439)
                     /direction=RIGHT
                     /label=ori
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"