我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来，主要是为了方便研究工作，其中一小部分质粒进行了质量控制，可供科学家使用。
所有的产品都严格仅供科学研究使用，不能应用于临床试验，包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。
确保质粒的关键元件正确，但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列，可能与测序结果不一致，请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序，本页面一般会提供下载)
开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%，则将其视为正确。
由于科学研究是在探索未知，具有很大的不确定性，在任何情况下，我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。
- 载体名称:
- pEBM113
- 载体抗性:
- Ampicillin
- 载体长度:
- 9485 bp
- 载体类型:
- Expression vector
- 复制子:
- ori
- 宿主:
- Yeast
- 载体来源:
- Mearls EB, Olson DG, Herring CD, Lynd LR.
- 启动子:
- URA3
pEBM113 载体图谱
质粒操作方法
1. 发货形式：质粒干粉(常温运输，存于-20度，请务必先转化提质粒后使用)
2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min，再加入20μl ddH2O溶解质粒;（质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大，这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致，因此建议先转化提质粒后再使用）
3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min，加入2μl质粒，再冰浴30min后，42℃热激60s，不要搅动，再冰浴2min；
4. 加入900μl无抗的LB液体培养基，180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);
5. 6000rpm离心5min，仅留100μl上清液重悬细菌沉淀，并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;
6. 将平板倒置37℃培养14h，如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化；没有菌落则加入10μl质粒转化；建议不要直接转表达感受态， 要先转克隆感受态，重提质粒后再导入表达感受态);
7. 挑取单菌落至LB液体培养基中，加入对应抗生素，220rpm震荡培养14h，根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
pEBM113 载体序列
LOCUS V007676 9485 bp DNA circular SYN 17-DEC-2018
DEFINITION Exported.
ACCESSION V007676
VERSION V007676
KEYWORDS .
SOURCE synthetic DNA construct
ORGANISM synthetic DNA construct
.
REFERENCE 1 (bases 1 to 9485)
AUTHORS Mearls EB, Olson DG, Herring CD, Lynd LR.
TITLE Development of a regulatable plasmid-based gene expression system
for Clostridium thermocellum
JOURNAL Appl. Microbiol. Biotechnol. 99 (18), 7589-7599 (2015)
PUBMED 25994254
REFERENCE 2 (bases 1 to 9485)
AUTHORS Argyros A, Mearls EB.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (13-MAR-2013) Engineering, Dartmouth College, 14
Engineering Dr, Hanover, NH 03755, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 9485)
TITLE Direct Submission
REFERENCE 4 (bases 1 to 9485)
AUTHORS .
TITLE Direct Submission
COMMENT SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: "Appl.
Microbiol. Biotechnol."; date: "2015"; volume: "99"; issue: "18";
pages: "7589-7599"
SGRef: number: 2; type: "Journal Article"; journalName: "Submitted
(13-MAR-2013) Engineering, Dartmouth College, 14 Engineering Dr,
Hanover, NH 03755, USA"
SGRef: number: 3; type: "Journal Article"
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..9485
/mol_type="other DNA"
/organism="synthetic DNA construct"
terminator 57..304
/label="CYC1 terminator"
/note="transcription terminator for CYC1"
rep_origin complement(552..1140)
/direction=LEFT
/label="ori"
/note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
replication"
CDS complement(1314..2171)
/label="AmpR"
/note="beta-lactamase"
CDS complement(2270..3070)
/label="URA3"
/note="orotidine-5'-phosphate decarboxylase, required for
uracil biosynthesis"
promoter complement(3071..3291)
/label="URA3 promoter"
misc_feature 3319..3822
/label="CEN/ARS"
/note="S. cerevisiae CEN6 centromere fused to an
autonomously replicating sequence"
CDS complement(4054..5055)
/label="repB"
/note="RepB replication protein"
regulatory 5541..6188
/gene="gapD"
/regulatory_class="promoter"
gene 5541..6188
/gene="gapD"
/label="gapD"
CDS 6189..6836
/gene="cat"
/label="Chloramphenicol acetyltransferase"
/note="Chloramphenicol acetyltransferase from
Staphylococcus aureus. Accession#: P00485"
regulatory 7417..7456
/regulatory_class="terminator"
regulatory 7464..7502
/gene="celC"
/regulatory_class="promoter"
gene 7464..7502
/gene="celC"
/label="celC"
CDS 7626..8663
/codon_start=1
/gene="glyR3"
/product="GlyR3"
/label="glyR3"
/note="repressor"
/protein_id="AGT95728.1"
/translation="MTSEEIAKLCGVSRATVSRVINNSPNVKEETRQKILAVIKEKNYV
PIAPARRLAGIDSNIIGLFVLDIDISESKSRVSESTYFSRLINLIIDQANNFGFQVLVS
IITSQKQLSEIRNLFMSRTIFSGIFIGAFNDEIQLDDDIIMQHPTIIIDRQSERMVKKP
NRLVVNLDNFEGAYNATQFLIKLGHTRIGHISGDLRKLSGIERYEGYKKALEDAGLGFD
KNLVREGNFLDDSGYRLAREILKENVTAIFCANDVMAISAIKAIKETGLSVPDDISVIG
FDNTAIGNYIMPALTTVNAPLEHIAEACIESLKYFCEHKHFKQKEIRVKTDLIIRDSTK
RALEF"
gene 7626..8663
/gene="glyR3"
/label="glyR3"
CDS 8676..9485
/codon_start=1
/gene="spo0A"
/product="Spo0A"
/label="spo0A"
/note="sporulation response regulator A"
/protein_id="AGT95729.1"
/translation="MTSNKIRVVIADDNREFGDILYEYLNNQEDIEVVGVARDGIEAYE
LIVEKLPDIAILDIIMPHLDGLGVLEKIGATAISKRPLFIILSAVGQDKITQRALALGA
EYYVVKPFDMEVLISRIRQLKNVNQPNVIRQDGLSGEVKSSYHPPQPKNLEAEVTNIMH
EIGVPAHIKGYQYLRDAIIMVVKDLDVINSITKQLYPTIAKEYNTTPSRVERAIRHAIE
VAWSRGQIDTIDSLFGYTINVGKGKPTNSEFIAMVADKLRLEMKMAT"
gene 8676..9485
/gene="spo0A"
/label="spo0A"