我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来，主要是为了方便研究工作，其中一小部分质粒进行了质量控制，可供科学家使用。
所有的产品都严格仅供科学研究使用，不能应用于临床试验，包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。
确保质粒的关键元件正确，但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列，可能与测序结果不一致，请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序，本页面一般会提供下载)
开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%，则将其视为正确。
由于科学研究是在探索未知，具有很大的不确定性，在任何情况下，我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。
pKD46 is a vector for recombineering in E. coli and other bacteria, which make chromosomal deletions of genes with FRT sites. pKD46 carries the λ red genes behind the araBAD promoter & is temperature sensitive (grow at <= 32 °C to maintain the plasmid).
- 载体名称:
- pKD46
- 载体抗性:
- Ampicillin
- 载体长度:
- 6329 bp
- 载体类型:
- Knockout Vectors
- 复制子:
- pSC101 ori
- 拷贝数:
- Low copy number
- 启动子:
- araBAD
- 克隆方法:
- Enzyme digestion and ligation
- 感受态:
- DH10B
- 培养温度:
- 30℃
pKD46 载体图谱
质粒操作方法
1. 发货形式：质粒干粉(常温运输，存于-20度，请务必先转化提质粒后使用)
2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min，再加入20μl ddH2O溶解质粒;（质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大，这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致，因此建议先转化提质粒后再使用）
3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min，加入2μl质粒，再冰浴30min后，42℃热激60s，不要搅动，再冰浴2min；
4. 加入900μl无抗的LB液体培养基，180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);
5. 6000rpm离心5min，仅留100μl上清液重悬细菌沉淀，并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;
6. 将平板倒置37℃培养14h，如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化；没有菌落则加入10μl质粒转化；建议不要直接转表达感受态， 要先转克隆感受态，重提质粒后再导入表达感受态);
7. 挑取单菌落至LB液体培养基中，加入对应抗生素，220rpm震荡培养14h，根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
pKD46 载体序列
LOCUS Exported 6329 bp DNA circular SYN 05-SEP-2024
DEFINITION synthetic circular DNA.
ACCESSION .
VERSION .
KEYWORDS .
SOURCE synthetic DNA construct
ORGANISM synthetic DNA construct
REFERENCE 1 (bases 1 to 6329)
TITLE Direct Submission
REFERENCE 2 (bases 1 to 6329)
TITLE Direct Submission
REFERENCE 3 (bases 1 to 6329)
AUTHORS .
TITLE Direct Submission
COMMENT SGRef: number: 1; type: "Journal Article"
COMMENT SGRef: number: 2; type: "Journal Article"
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..6329
/mol_type="other DNA"
/organism="synthetic DNA construct"
CDS complement(14..889)
/codon_start=1
/label=araC
/note="L-arabinose regulatory protein"
/translation="MAEAQNDPLLPGYSFNAHLVAGLTPIEANGYLDFFIDRPLGMKGY
ILNLTIRGQGVVKNQGREFVCRPGDILLFPPGEIHHYGRHPEAREWYHQWVYFRPRAYW
HEWLNWPSIFANTGFFRPDEAHQPHFSDLFGQIINAGQGEGRYSELLAINLLEQLLLRR
MEAINESLHPPMDNRVREACQYISDHLADSNFDIASVAQHVCLSPSRLSHLFRQQLGIS
VLSWREDQRISQAKLLLSTTRMPIATVGRNVGFDDQLYFSRVFKKCTGASPSEFRAGCE
EKVNDVAVKLS"
promoter 916..1200
/label=araBAD promoter
/note="promoter of the L-arabinose operon of E. coli; the
araC regulatory gene is transcribed in the opposite
direction (Guzman et al., 1995)"
CDS 1244..1657
/codon_start=1
/label=Gam
/note="inhibitor of the host RecBCD nuclease in the lambda
Red system"
/translation="MDINTETEIKQKHSLTPFPVFLISPAFRGRYFHSYFRSSAMNAYY
IQDRLEAQSWARHYQQLAREEKEAELADDMEKGLPQHLFESLCIDHLQRHGASKKSITR
AFDDDVEFQERMAEHIRYMVETIAHHQVDIDSEV"
CDS 1666..2448
/codon_start=1
/label=Beta
/note="single-stranded DNA binding recombinase in the
lambda Red system"
/translation="MSTALATLAGKLAERVGMDSVDPQELITTLRQTAFKGDASDAQFI
ALLIVANQYGLNPWTKEIYAFPDKQNGIVPVVGVDGWSRIINENQQFDGMDFEQDNESC
TCRIYRKDRNHPICVTEWMDECRREPFKTREGREITGPWQSHPKRMLRHKAMIQCARLA
FGFAGIYDKDEAERIVENTAYTAERQPERDITPVNDETMQEINTLLIALDKTWDDDLLP
LCSQIFRRDIRASSELTQAEAVKALGFLKQKAAEQKVAA"
CDS 2448..3125
/codon_start=1
/label=Exo
/note="5' to 3' double-stranded DNA exonuclease in the
lambda
Red system"
/translation="MTPDIILQRTGIDVRAVEQGDDAWHKLRLGVITASEVHNVIAKPR
SGKKWPDMKMSYFHTLLAEVCTGVAPEVNAKALAWGKQYENDARTLFEFTSGVNVTESP
IIYRDESMRTACSPDGLCSDGNGLELKCPFTSRDFMKFRLGGFEAIKSAYMAQVQYSMW
VTRKNAWYFANYDPRMKREGLHYVVIERDEKYMASFDEIVPEFIEKMDEALAEIGFVFG
EQWR"
terminator 3129..3373
/label=lambda tL3 terminator
/note="transcription terminator tL3 from phage lambda"
CDS complement(3499..4446)
/codon_start=1
/label=Rep101
/note="RepA protein needed for replication with the pSC101
origin"
/translation="MSELVVFKANELAISRYDLTEHETKLILCCVALLNPTIENPTRKE
RTVSFTYNQYAQMMNISRENAYGVLAKATRELMTRTVEIRNPLVKGFEIFQWTNYAKFS
SEKLELVFSEEILPYLFQLKKFIKYNLEHVKSFENKYSMRIYEWLLKELTQKKTHKANI
EISLDEFKFMLMLENNYHEFKRLNQWVLKPISKDLNTYSNMKLVVDKRGRPTDTLIFQV
ELDRQMDLVTELENNQIKMNGDKIPTTITSDSYLRNGLRKTLHDALTAKIQLTSFEAKF
LSDMQSKYDLNGSFSWLTQKQRTTLENILAKYGRI"
rep_origin complement(4494..4716)
/direction=LEFT
/label=pSC101 ori
/note="low-copy replication origin that requires the Rep101
protein"
CDS complement(5341..6198)
/codon_start=1
/label=AmpR
/note="beta-lactamase"
/translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
LIKHW"
promoter complement(6199..6303)
/label=AmpR promoter