p2CT-His-MBP-Lbu_C2c2_WT 载体 (V010157)

我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来,主要是为了方便研究工作,其中一小部分质粒进行了质量控制,可供科学家使用。

所有的产品都严格仅供科学研究使用,不能应用于临床试验,包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。

确保质粒的关键元件正确,但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列,可能与测序结果不一致,请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序,本页面一般会提供下载)

开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%,则将其视为正确。

由于科学研究是在探索未知,具有很大的不确定性,在任何情况下,我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。

Bacterial expression of WT L. buccalis C2c2 CRISPR effector. Codon optimized for E. Coli expression. His-MBP fusion tag can be removed with TEV protease.

载体名称:
p2CT-His-MBP-Lbu_C2c2_WT
载体抗性:
Ampicillin
载体长度:
9437 bp
载体类型:
CRISPR Plasmids
复制子:
ori
载体来源:
Jennifer Doudna
拷贝数:
High copy number
启动子:
tet
克隆方法:
Enzyme Cut
5'引物:
T7 promoter
3'引物:
T7 terminator
载体标签:
MBP
表达方法:
IPTG induced

p2CT-His-MBP-Lbu_C2c2_WT 载体图谱

p2CT-His-MBP-Lbu_C2c2_WT9437 bp400800120016002000240028003200360040004400480052005600600064006800720076008000840088009200AmpR promoterAmpRoribomropT7 promoterRBS6xHisMBPTEV siteCRISPR-associated endoribonuclease Cas13aT7 terminatortet promoter

质粒操作方法

1. 发货形式:质粒干粉(常温运输,存于-20度,请务必先转化提质粒后使用)

2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min,再加入20μl ddH2O溶解质粒;(质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大,这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致,因此建议先转化提质粒后再使用)

3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min,加入2μl质粒,再冰浴30min后,42℃热激60s,不要搅动,再冰浴2min;

4. 加入900μl无抗的LB液体培养基,180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);

5. 6000rpm离心5min,仅留100μl上清液重悬细菌沉淀,并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;

6. 将平板倒置37℃培养14h,如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化;没有菌落则加入10μl质粒转化;建议不要直接转表达感受态, 要先转克隆感受态,重提质粒后再导入表达感受态);

7. 挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220rpm震荡培养14h,根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。

p2CT-His-MBP-Lbu_C2c2_WT 载体序列

LOCUS       V010157                 9437 bp    DNA     circular SYN 03-JUL-2018
DEFINITION  Exported.
ACCESSION   V010157
VERSION     V010157
KEYWORDS    p2CT-His-MBP-Lbu-C2c2-WT
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
            .
REFERENCE   1  (bases 1 to 9437)
  AUTHORS   East-Seletsky A, O'Connell MR, Knight SC, Burstein D, Cate JH, Tjian
            R, Doudna JA
  TITLE     Two distinct RNase activities of CRISPR-C2c2 enable guide-RNA
            processing and RNA detection.
  JOURNAL   Nature. 2016 Sep 26. doi: 10.1038/nature19802.
   PUBMED   27669025
REFERENCE   2  (bases 1 to 9437)
  TITLE     Direct Submission
REFERENCE   3  (bases 1 to 9437)
  AUTHORS   .
  TITLE     Direct Submission
COMMENT     SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: "Nature.
            2016 Sep 26. doi: 10.1038/nature19802."
            SGRef: number: 2; type: "Journal Article"
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..9437
                     /mol_type="other DNA"
                     /organism="synthetic DNA construct"
     promoter        104..208
                     /label="AmpR promoter"
     CDS             209..1066
                     /label="AmpR"
                     /note="beta-lactamase"
     rep_origin      1240..1828
                     /label="ori"
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
                     replication"
     misc_feature    complement(2014..2156)
                     /label="bom"
                     /note="basis of mobility region from pBR322"
     CDS             complement(2261..2449)
                     /label="rop"
                     /note="Rop protein, which maintains plasmids at low copy
                     number"
     promoter        4010..4028
                     /label="T7 promoter"
                     /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase"
     RBS             4117..4139
                     /label="RBS"
                     /note="efficient ribosome binding site from bacteriophage
                     T7 gene 10 (Olins and Rangwala, 1989)"
     CDS             4159..4176
                     /label="6xHis"
                     /note="6xHis affinity tag"
     CDS             4186..5286
                     /label="MBP"
                     /note="maltose binding protein from E. coli"
     CDS             5341..5361
                     /label="TEV site"
                     /note="tobacco etch virus (TEV) protease recognition and
                     cleavage site"
     CDS             5368..8844
                     /gene="cas13a"
                     /label="CRISPR-associated endoribonuclease Cas13a"
                     /note="CRISPR-associated endoribonuclease Cas13a from
                     Leptotrichia buccalis (strain ATCC 14201 / DSM 1135 / JCM
                     12969 / NCTC 10249 / C-1013-b). Accession#: C7NBY4"
     terminator      8987..9034
                     /label="T7 terminator"
                     /note="transcription terminator for bacteriophage T7 RNA
                     polymerase"
     promoter        complement(9400..9428)
                     /label="tet promoter"
                     /note="E. coli promoter for tetracycline efflux protein
                     gene"