我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来,主要是为了方便研究工作,其中一小部分质粒进行了质量控制,可供科学家使用。
所有的产品都严格仅供科学研究使用,不能应用于临床试验,包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。
确保质粒的关键元件正确,但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列,可能与测序结果不一致,请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序,本页面一般会提供下载)
开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%,则将其视为正确。
由于科学研究是在探索未知,具有很大的不确定性,在任何情况下,我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。
Bacterial expression of WT L. buccalis C2c2 CRISPR effector. Codon optimized for E. Coli expression. His-MBP fusion tag can be removed with TEV protease.
- 载体名称:
- p2CT-His-MBP-Lbu_C2c2_WT
- 载体抗性:
- Ampicillin
- 载体长度:
- 9437 bp
- 载体类型:
- CRISPR Plasmids
- 复制子:
- ori
- 载体来源:
- Jennifer Doudna
- 拷贝数:
- High copy number
- 启动子:
- tet
- 克隆方法:
- Enzyme Cut
- 5'引物:
- T7 promoter
- 3'引物:
- T7 terminator
- 载体标签:
- MBP
- 表达方法:
- IPTG induced
p2CT-His-MBP-Lbu_C2c2_WT 载体图谱
质粒操作方法
1. 发货形式:质粒干粉(常温运输,存于-20度,请务必先转化提质粒后使用)
2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min,再加入20μl ddH2O溶解质粒;(质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大,这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致,因此建议先转化提质粒后再使用)
3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min,加入2μl质粒,再冰浴30min后,42℃热激60s,不要搅动,再冰浴2min;
4. 加入900μl无抗的LB液体培养基,180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);
5. 6000rpm离心5min,仅留100μl上清液重悬细菌沉淀,并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;
6. 将平板倒置37℃培养14h,如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化;没有菌落则加入10μl质粒转化;建议不要直接转表达感受态, 要先转克隆感受态,重提质粒后再导入表达感受态);
7. 挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220rpm震荡培养14h,根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
p2CT-His-MBP-Lbu_C2c2_WT 载体序列
LOCUS V010157 9437 bp DNA circular SYN 03-JUL-2018 DEFINITION Exported. ACCESSION V010157 VERSION V010157 KEYWORDS p2CT-His-MBP-Lbu-C2c2-WT SOURCE synthetic DNA construct ORGANISM synthetic DNA construct . REFERENCE 1 (bases 1 to 9437) AUTHORS East-Seletsky A, O'Connell MR, Knight SC, Burstein D, Cate JH, Tjian R, Doudna JA TITLE Two distinct RNase activities of CRISPR-C2c2 enable guide-RNA processing and RNA detection. JOURNAL Nature. 2016 Sep 26. doi: 10.1038/nature19802. PUBMED 27669025 REFERENCE 2 (bases 1 to 9437) TITLE Direct Submission REFERENCE 3 (bases 1 to 9437) AUTHORS . TITLE Direct Submission COMMENT SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: "Nature. 2016 Sep 26. doi: 10.1038/nature19802." SGRef: number: 2; type: "Journal Article" FEATURES Location/Qualifiers source 1..9437 /mol_type="other DNA" /organism="synthetic DNA construct" promoter 104..208 /label="AmpR promoter" CDS 209..1066 /label="AmpR" /note="beta-lactamase" rep_origin 1240..1828 /label="ori" /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of replication" misc_feature complement(2014..2156) /label="bom" /note="basis of mobility region from pBR322" CDS complement(2261..2449) /label="rop" /note="Rop protein, which maintains plasmids at low copy number" promoter 4010..4028 /label="T7 promoter" /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase" RBS 4117..4139 /label="RBS" /note="efficient ribosome binding site from bacteriophage T7 gene 10 (Olins and Rangwala, 1989)" CDS 4159..4176 /label="6xHis" /note="6xHis affinity tag" CDS 4186..5286 /label="MBP" /note="maltose binding protein from E. coli" CDS 5341..5361 /label="TEV site" /note="tobacco etch virus (TEV) protease recognition and cleavage site" CDS 5368..8844 /gene="cas13a" /label="CRISPR-associated endoribonuclease Cas13a" /note="CRISPR-associated endoribonuclease Cas13a from Leptotrichia buccalis (strain ATCC 14201 / DSM 1135 / JCM 12969 / NCTC 10249 / C-1013-b). Accession#: C7NBY4" terminator 8987..9034 /label="T7 terminator" /note="transcription terminator for bacteriophage T7 RNA polymerase" promoter complement(9400..9428) /label="tet promoter" /note="E. coli promoter for tetracycline efflux protein gene"