微生物具有容易变异的特性，因此，在保藏过程中，必须使微生物的代谢处于最不活跃或相对静止的状态，才能在一定的时间内使其不发生变异而又保持生活能力。
选用优良菌株，根据生理生化特征隔绝空气使其处于休眠状态或者代谢处于最低的状态，生长繁殖受抑制从而降低变异率。
此法实用而效果好。霉菌、放线菌、芽孢细菌可保藏2年以上不死，酵母菌可保藏1-2年，一般无芽孢细菌也可保藏1年左右，甚至用一般方法很难保藏的脑膜炎球菌，在37℃温箱内，亦可保藏3个月之久。此法的优点是制作简单，不需特殊设备，且不需经常移种。缺点是保存时必须直立放置，所占位置较大，同时也不便携带。从液体石蜡下面取培养物移种后，接种环在火焰上烧灼时，培养物容易与残留的液体石蜡一起飞溅，应特别注意。
一、将液体石蜡分装于三角烧瓶内，塞上棉塞，并用牛皮纸包扎，1.05 kg/cm
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，121.3℃灭菌30分钟，然后放在40℃温箱中，使水汽蒸发掉，备用。
二、将需要保藏的菌种，在最适宜的斜面培养基中培养，使得到健壮的菌体或孢子。
三、用灭菌吸管吸取灭菌的液体石蜡，注入已长好菌的斜面上，其用量以高出斜面顶端1 cm为准，使菌种与空气隔绝。
四、将试管直立，置低温或室温下保存（有的微生物在室温下比冰箱中保存的时间还要长）。