一、 原虫包囊染色检查法

将碘液滴于载玻片中央，用竹签挑取粪便少许，在碘液中涂匀，加上盖玻片后镜检。

二、 隐孢子虫卵囊染色检查法

隐孢子虫卵囊染色检查法可分为金胺-酚染色法、改良抗酸染色法以及金胺-酚染色-改良抗酸复染法。

1. 金胺-酚染色法

（1）染液配制：1g/L金胺-酚染色液（第一液）：金胺0.1g，石炭酸5.0g，蒸馏水100ml；3%盐酸酒精（第二液）：盐酸3ml，95%酒精100ml；5 g/L高锰酸钾（第三液）：高锰酸钾0.5g，蒸馏水100ml。

（2）染色步骤：滴加第一液于晾干的粪膜上，10～15分钟后水洗；滴加第二液，1分钟后水洗；滴加第三液，1 分钟后水洗，待干；置荧光显微镜下检查。

2. 改良抗酸染色法

（1）染色液配制：石炭酸复红染色液（第一液）：碱性复红4g，95%酒精20ml，石炭酸8 ml，蒸馏水100ml；10%硫酸溶液（第二液）：纯硫酸10 ml，蒸馏水90ml（边搅拌边将硫酸徐徐倾入水中）；20 g/L孔雀绿液（第三液）：20 g/L孔雀绿原液1ml，蒸馏水10ml。

（2）染色步骤：滴加第一液于晾干的粪膜上，1.5～10分钟后水洗；滴加第二液，1～10分钟后水洗；滴加第三液，1 分钟后水洗，待干；置显微镜下观察。