将培养物移至另一培养箱，关闭空培养箱电源，然后用去污剂和乙醇擦洗，开启加热开关，以便使培养箱干燥。盘中换新鲜水，重新通入 CO2。
1. 将全部培养物移至另一个 CO 2 培养箱，或将培养物装入可密封的容器中（如干燥器），通入 CO 2 气体，然后放置于普通培养箱或温室中。
2. 将准备清洁的温箱断开电源。
3. 将温箱中所有的隔板及水盘和可拆卸的部件取出。
4. 用含有去污剂（10 % Roccal，或其他杀菌去污剂）的溶液清洗温箱内部，尽可能擦抹每个角落及缝隙处。
5. 用清水冲洗。
6. 用 70 % 乙醇擦洗温箱内部。
7. 在保持门打开的状态下，加热（不通 CO 2 气体）直至温箱干燥。
8. 用去污剂擦洗隔板及各种部件，然后用清水冲洗，用 70 % 乙醇擦洗。
9. 将隔板及各种部件放回温箱中。
10. 放回水盘，注入含有 2 % Roccal 的水。
11. 关门并接通 CO 2 气体。
12. 当温度和 CO 2 已趋于稳定，将培养物放回温箱。