2.  用 ³² P末端标记消化产物，5’末端可先用小牛肠碱性磷酸酶处理。

3.  用T4多核苷酸激酶进行标记。

4.  3’末端可先用大肠扞菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或T4 DNA聚合酶来标记。

5.  用第二种内切酶消化DNA片段，通过凝胶电泳分离产物，纯化那些仅单末端带放射性标记的DNA片段。

6.  用系列稀释酶法以相对高频度切割的限制酶部分消化分离的DNA片段，电泳分离片段并进行自显影曝光。

7.  用放射性标记的DNA分子量标准，估算出片段的长度。