来源：基迪奥生物 作者：周老师

什么是环状RNA？怎么产生？

大多数环状RNA来自编码基因，有下面两种常见的形式：

环状RNA的发现

环状RNA在30年前就已经在电子显微镜中被发现，之后一直都有陆续报道。但环状RNA毫无存在感，连个路人都称不上哈，因为他的表达丰度很低，很多人觉得他是转录的噪音，并没什么卵用。直到一个女学霸出现了……

直到2012年，duang一下，一篇环状RNA比较全面靠谱的报道出来了，居然来自《plos one》。

作者是斯坦福大学的Julia Salzman，长这样，是不是一副女学霸的样子（我们真的没有歧视女学霸）

这位女学霸最初应该只是想利用RNA-seq研究癌症相关的染色体重排或基因融合，无意中发现了环状RNA不但在癌细胞样本中存在，而且在人正常细胞系、小鼠脑组织中也大量存在，而且表达丰度还不低。

估计他们在2011年的《plos Biology》研究卵巢癌基因融合的一篇文章“ESRRA-C11orf20 is a Recurrent Gene Fusion in Serous Ovarian Carcinoma”中，已经发现了环状RNA的存在了，只是没吭声而已。（其实我们是觉得这太巧合了，于是周老师就扒了一下这位女学霸之前发表的文章，呵呵哒~）

然后他们整理整理，只是将基础数据于2012年发表在了plos one上。可能是担心同行竞争，先抢先发一篇，有点便宜plos one。看来plos one也并非没有好文章嘛（但2015年plos one的影响因子又降了）。

从这以后，环状RNA总算是红了，相关文章也多了起来

当然， 女学霸他们也没有停下来。他们将数据范围扩大了一下，分析了ENCODE的数据，还分析了小鼠和果蝇的数据。发现circle RNA果然普遍存在，环状RNA在细胞中的总量约占线性RNA的1%。部分环状RNA的丰度还不低，超过了对应等位基因位点的线性RNA。这个结果在2013年发表在了《plos genetic》（IF:7.528）上（看来他们还是非常钟情plos 系列嘛）。

然后我们再来看看环状RNA的稳定性

由于环状RNA可以抵抗核酸外切酶的降解作用，所以：

细胞内比较稳定，half time > 48h

但在血清中非常不稳定，half time 大概只有15s；

环状RNA生物学功能

最常见的可能机制：竞争性内源RNA——ceRNA

2013年，《nature》同时有两个团队报道，环状RNA可以结合吸附miR-7（microRNA），从而降低miR-7的活性，间接上调miR-7相关靶基因的表达。由于环状RNA的稳定性（环状不易降解），在机体内潜在对microRNA的吸附能力要强于线性的mRNA和lncRNA。

在其中一篇报道中表明，环状RNA——CDR1as对miR-7的吸附能力要10倍于其他任何线性转录本。

环状RNA存在的普遍性

物种：动植物，细菌，真菌，病毒中都存在。

高通量测序研究物种有人，小鼠，大鼠，线虫以及一些植物。

各类细胞系和组织：白细胞，成纤维细胞等有存在环状RNA。

也正是因为环状RNA的普遍性及结构功能，很多老师开始关注环状RNA研究。尤其是现在二代测序技术越来越成熟的情况下，目测未来将有一个环状RNA的研究浪潮~大家可以关注一下噢！

2015-07-22