一、NCBI——Gene

先说说最基本的NCBI，我们经常会用它来查各种资料，这次我们要用到的是里面的Gene（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/）。举个例子，Hotair，这个比较火的LncRNA。

点开后，首先就可以看到一个Summary，这就是对这个基因的整体分析了。但有了这个还不够，向下拉，可以发现一个叫做GeneRIF的栏目，这个栏目主要是注释了已有的对该基因的功能的报道。

点进See all，可看到所有的功能注释及文献表格。

二、NCBI——IEB

第二招还是在NCBI中的，不过这个有点冷门大家估计听都没听过，就是信息工程部（IEB，Information Engineering Branch）。看着好像基因的功能没什么关系，但IEB中有两个很实用的工具，一个是Aceview，另一个是Spidey。

Spidey主要做的是基因Blast，比如你做RACE获得了一个mRNA，但不知道是哪个基因，也不知道在哪个位置，用这个工具来Blast，能找出外显子内含子的分布，不过这对分子综述写作来说帮助不大，不过艺多不压身嘛，记着总是好的。

Aceview（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Acembly/index.html）主要是对基因的一种注释，对于基因的位置上下游，基因的功能，可能互作的基因，都有注释。同时，还可以采用Blast的方法，来搜索序列，获得序列所对应的基因的信息。蛮方便的不是么？但是有个小问题，就是里面所包含的信息基本上都是2010年前的信息，所以对于功能所注释的文章而言，有点老了。

那如果是要做与各种疾病相关的内容呢？那可以进到NCBI的Clin Var页面（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/）进行搜索，用PTEN做个例子。点击进入后，即可看见与PTEN相关的疾病表型，但这些表型内有良性的及不确定表型等，需要一个个去查看。

三、OMIM

最后要说的是OMIM（Online Mendelian Inheritance in Man）：人的孟德尔遗传网（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim）。一款公布在公众医学（PUBMED）上的资料库，支持在线搜索。主要内容是遗传和变异的基因的相关信息。其中对基因是如何克隆的，以及表达的描述，都是非常详尽的，同时也都附有相关文献的链接。用来做分子综述的参考也是没话说的！

来源：解螺旋

2016-06-14