显性负性结构域的特征、典型类型及应用设计原则

显性负性结构域是蛋白质中一类特殊的结构或功能区域,当以突变体或截短形式表达时,可通过争夺结合伴侣(如二聚化)或底物等方式,抑制细胞内野生型(正常版本)蛋白质的活性。其抑制作用具有 “显性” 特征 —— 即便细胞内存在内源性野生型蛋白质,仅表达该突变结构域就能干扰野生型蛋白的功能,无需删除野生型基因。

典型示例

肿瘤抑制蛋白 p53:需形成四聚体才能发挥作用,突变 p53(含显性负性结构域 p53DD,即小鼠 p53 (NM_011640) 删除 40-903 位氨基酸)会与野生型 p53 亚基结合,阻碍功能性四聚体的形成,进而抑制 p53 介导的 DNA 修复或细胞凋亡,这也是部分癌症中 p53 功能异常的原因之一。

MLH1dn(Uniprot ID: P40692):MLH1 基因删除 C 末端 3 个氨基酸(754-756 位残基)形成的显性负性结构域。MLH1 是错配修复(MMR)通路的核心蛋白,需与 PMS2、PMS1 或 MLH3 形成异二聚体发挥功能,其中 MLH1-PMS2 复合物是介导 DNA 链切割的关键核酸酶。754-756 位残基位于 MLH1 的 C 端金属结合结构域,直接参与 Mg²⁺等金属离子结合(金属离子是核酸酶切割磷酸二酯键的必需辅因子),该区域缺失(Δ754-756 突变)不影响 MLH1 与 PMS2 的结合能力,但会完全破坏复合物的核酸酶活性,表明其属于 “功能结构域” 而非 “结合结构域”。

主要类型及代表性突变体

1. 小 G 蛋白(Small GTPases)

这类蛋白的显性负性突变体应用广泛,通常通过突变关键残基使其锁定在 GDP 结合状态,进而隔离上游的鸟苷酸交换因子(GEF),阻断信号通路。

Ras S17N(Ser17→Asn):经典显性负性 Ras,与 GEF(如 Sos)紧密结合但无法被激活,抑制内源性 Ras 的活化。

Rac1 T17N / Cdc42 T17N:用于研究肌动蛋白骨架重组(如板状伪足和丝状伪足形成)的显性负性突变体。

RhoA T19N:用于抑制 RhoA 信号通路(如应力纤维形成)。

Dynamin K44A:动力蛋白的 GTP 酶缺陷型突变体,能组装在网格蛋白包被小泡的颈部,但无法水解 GTP,导致无法 “剪断” 小泡,从而强效阻断内吞作用。

2. 激酶(Kinases)

激酶的显性负性形式通常被称为 “Kinase-Dead”(KD)突变体,常见构建方式为 ATP 结合位点突变(K→A/M/R)。

适用范围:几乎所有激酶(如 Akt、MEK、ERK、PKC)均可通过该方式构建显性负性形式。

示例:Akt K179M。

机制:突变体保留底物结合能力或与其他支架蛋白的相互作用能力,但丧失催化活性,进而竞争性抑制野生型激酶。

3. 转录因子(Transcription Factors)

转录因子通常形成二聚体结合 DNA,其显性负性突变体多保留二聚化能力,但丧失 DNA 结合能力或转录激活能力。

KCREB(CREB 的显性负性突变体):在 DNA 结合的基本区域(Basic Region)引入点突变(如 R287L),能与野生型 CREB 形成二聚体,但该二聚体无法结合 CRE 序列。

TAM67(c-Jun 的显性负性突变体):缺失 N 端反式激活结构域(Transactivation Domain, TAD)的 c-Jun 突变体(缺失 3-122 位氨基酸),能与 c-Fos 或 c-Jun 形成二聚体并结合 DNA,但无法激活转录,以 “占位” 方式抑制 AP-1 活性。

A-Fos:酸性 c-Fos 突变体,含酸性两亲性螺旋延伸,能通过拉链结构与 Jun 蛋白紧密结合,但阻止复合物结合 DNA。

Id 蛋白(Inhibitor of DNA binding):天然存在的显性负性家族(如 Id1、Id2),拥有 HLH(Helix-Loop-Helix)二聚化结构域,但天然缺乏结合 DNA 所需的 Basic 结构域,通过与 MyoD 等 bHLH 转录因子形成异二聚体抑制分化。

4. 膜受体(Membrane Receptors)

膜受体的显性负性形式多为缺失胞内信号传导结构域的截短体。

DN-EGFR(如 CD533):缺失胞内酪氨酸激酶结构域的 EGFR,能与野生型 EGFR 形成二聚体,但无法进行跨磷酸化,从而阻断信号。

DN-TGFβRII:缺失胞内激酶结构域的 TGF-β II 型受体,用于阻断 TGF-β 信号通路。

Notch 信号抑制剂:包括 DN-MAML1(Mastermind-like 1 的显性负性形式,阻断 Notch 转录复合物的组装),或表达缺失胞内域的 Notch 受体。

5. 信号通路抑制因子(Pathway Inhibitors)

这类蛋白虽非严格意义上的 “结构域突变”,但在实验中常作为显性负性工具使用,典型代表为 IκBα-SR(Super Repressor)。

特征:IκBα 的突变体(S32A/S36A),两个丝氨酸的突变使其无法被磷酸化和降解。

机制:将 NF-κB 永久锁在细胞质中,强效抑制 NF-κB 通路。

设计与寻找原则

针对酶(激酶 / GTP 酶):寻找催化中心的关键残基进行点突变,构建 “死酶” 形式。

针对多聚体蛋白(受体 / 转录因子):保留二聚化 / 多聚化结构域,切除功能结构域(如 DNA 结合域或激酶域)。

Souce: 纽普生物    2025-12-04