产品详情
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产品名称
LDKA form多肽
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序列
H-GLLDLLKLLLKAAG-OH
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三字母序列
H-Gly-Leu-Leu-Asp-Leu-Leu-Lys-Leu-Leu-Leu-Lys-Ala-Ala-Gly-OH
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长度 (aa)
14
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多肽纯度 (HPLC, %)
95.2
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分子式
C68H124N16O17
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分子量(Da)
1437.8
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来源
固相合成
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描述
In the age of failing small-molecule antibiotics, tapping the near-infinite structural and chemical repertoire of antimicrobial peptides (AMPs) offers one of the most promising routes toward developing next-generation antibacterial compounds. One of the key impediments en route is the lack of methodologies for systematic rational design and optimization of new AMPs. Here we present a new simulation-guided rational design approach and apply it to develop a potent new AMP. We show that unbiased atomic detail molecular dynamics (MD) simulations are able to predict structures formed by evolving peptide designs enabling structure-based rational fine-tuning of functional properties. Starting from a 14-residue poly leucine template we demonstrate the design of a minimalistic potent new AMP. Consisting of only four types of amino acids (LDKA), this peptide forms large pores in microbial membranes at very low peptide-to-lipid ratios (1:1000) and exhibits low micromolar activity against common Gram-positive and Gram-negative pathogenic bacteria. Remarkably, the four amino acids were sufficient to encode preferential poration of bacterial membranes with negligible damage to red blood cells at bactericidal concentrations. As the sequence is too short to span cellular membranes, pores are formed by stacking of channels in each bilayer leaflet.
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储存指南
一般情况下， LDKA form多肽 粉末应该保存在-20甚至-70摄氏度. LDKA form多肽 溶解后应该-70摄氏度分装保存，避免反复冻融. 了解更多细节，请查阅手册:多肽溶解及保存指南
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参考文献
- Chen CH, Starr CG, Troendle E, Wiedman G, Wimley WC, Ulmschneider JP, Ulmschneider MB. Simulation-Guided Rational de Novo Design of a Small Pore-Forming Antimicrobial Peptide. J Am Chem Soc. 2019 Mar 27;141(12):4839-4848. doi: 10.1021/jacs.8b11939. Epub 2019 Mar 13. PMID: 30839209.
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关于三氟乙酸盐
三氟乙酸（Trifluoroacetic acid，简称 TFA）是高效液相色谱（简称 HPLC）纯化过程中常用的反离子。TFA 的存在可能会对肽的净重量、外观及溶解度产生影响，具体如下：
对净重量的影响：TFA 盐会增加产物的总质量。在大多数情况下，肽的含量占总重量的 80% 以上，剩余部分则为 TFA。
对溶解度的影响：TFA 盐通常能提高肽在水溶液中的溶解度。
在生物检测中的影响：对于大多数标准的体外检测，残留的 TFA 水平一般不会造成干扰。但需注意，在高灵敏度的细胞研究或生化研究中，需关注其存在可能带来的影响。
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关于多肽净含量
干品多肽的重量中不仅仅包含多肽，还包含有一些非肽的组份，如水、被吸收的溶剂、配位离子和盐等。肽的净含量是指肽在其中的重量百分比，这个百分比的数值范围很大，可能从50%到90%，取决于纯度、序列以及合成和纯化的方法，不要将肽的净含量和肽的纯度混为一谈，他们是两个完全不同的概念。纯度通常是通过HPLC测定的。纯度定义的是多肽样品中含正确序列的组分的百分比，而肽的净含量是指样品中肽类物质相对于总物质所占的百分比，肽的净含量通常是氨基酸组分分析或紫外分光法测定的，这个信息主要是在一些对肽的浓度很敏感的实验中，对计算肽的浓度是很重要的。
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摩尔浓度计算器
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稀释计算器
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百分比浓度计算器
质量 (g) = 浓度 (mol/L) × 体积 (L) × 分子量 (g/mol)
相关服务
多肽合成服务: 纽普生物（NovoPro）提供常规多肽合成、糖修饰多肽合成、稳定同位素标记的多肽合成、磷酸化多肽合成、荧光标记多肽、多肽的BSA/KLH/OVA等载体蛋白的偶联等服务。