- 序列:NMA-IEALFQGPPK(DNP)FR
- 分子式:C81H112N20O21
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产品详情
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产品名称
P08 多肽
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序列
NMA-IEALFQGPPK(DNP)FR
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三字母序列
NMA-Ile-Glu-Ala-Leu-Phe-Gln-Gly-Pro-Pro-Lys-DNP-Phe-Arg-OH
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长度 (aa)
12
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多肽纯度 (HPLC, %)
95.47
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分子式
C81H112N20O21
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分子量(Da)
1701.91
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来源
固相合成
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描述
The peptide P08, with the sequence NMA-IEALFQGPPK(DNP)FR, is a fluorogenic peptide substrate that was determined to be the most efficiently cleaved by EV71 3C protease. It has a kinetic constant kcat / Km of 11.8 ± 0.82 mM⁻¹ min⁻¹. The substrate specificity study revealed that EV71 3C protease showed strong preference for the P2 and P1' residues of P08. Variants at these positions dramatically reduced the cleavage efficiency by the protease. Molecular dynamics simulations suggested that Arg39, located at the bottom of the S2 pocket of EV71 3C protease, may assist the process of cleavage of the substrate by interacting with the Phe residue at the P2 position of P08. P08 is an ideal substrate for biochemical characterization of EV71 3C protease and for the development of a biochemical assay for screening EV71 3C protease inhibitors. NMA=2-(N-methylamino)benzoyl. λex=340 nm and λem=440 nm for NMA/DNP.
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储存指南
一般情况下, P08 多肽 粉末应该保存在-20甚至-70摄氏度. P08 多肽 溶解后应该-70摄氏度分装保存,避免反复冻融. 了解更多细节,请查阅手册:多肽溶解及保存指南
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参考文献
- Shang L, Zhang S, Yang X, Sun J, Li L, Cui Z, He Q, Guo Y, Sun Y, Yin Z. Biochemical characterization of recombinant Enterovirus 71 3C protease with fluorogenic model peptide substrates and development of a biochemical assay. Antimicrob Agents Chemother. 2015 Apr;59(4):1827-36. doi: 10.1128/AAC.04698-14. Epub 2014 Nov 24. PMID: 25421478; PMCID: PMC4356770.
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关于三氟乙酸盐
三氟乙酸(Trifluoroacetic acid,简称 TFA)是高效液相色谱(简称 HPLC)纯化过程中常用的反离子。TFA 的存在可能会对肽的净重量、外观及溶解度产生影响,具体如下:
对净重量的影响:TFA 盐会增加产物的总质量。在大多数情况下,肽的含量占总重量的 80% 以上,剩余部分则为 TFA。
对溶解度的影响:TFA 盐通常能提高肽在水溶液中的溶解度。
在生物检测中的影响:对于大多数标准的体外检测,残留的 TFA 水平一般不会造成干扰。但需注意,在高灵敏度的细胞研究或生化研究中,需关注其存在可能带来的影响。
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关于多肽净含量
干品多肽的重量中不仅仅包含多肽,还包含有一些非肽的组份,如水、被吸收的溶剂、配位离子和盐等。肽的净含量是指肽在其中的重量百分比,这个百分比的数值范围很大,可能从50%到90%,取决于纯度、序列以及合成和纯化的方法,不要将肽的净含量和肽的纯度混为一谈,他们是两个完全不同的概念。纯度通常是通过HPLC测定的。纯度定义的是多肽样品中含正确序列的组分的百分比,而肽的净含量是指样品中肽类物质相对于总物质所占的百分比,肽的净含量通常是氨基酸组分分析或紫外分光法测定的,这个信息主要是在一些对肽的浓度很敏感的实验中,对计算肽的浓度是很重要的。
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摩尔浓度计算器
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稀释计算器
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百分比浓度计算器
质量 (g) = 浓度 (mol/L) × 体积 (L) × 分子量 (g/mol)
相关服务
多肽合成服务: 纽普生物(NovoPro)提供常规多肽合成、糖修饰多肽合成、稳定同位素标记的多肽合成、磷酸化多肽合成、荧光标记多肽、多肽的BSA/KLH/OVA等载体蛋白的偶联等服务。