本工具是复用 ProteinMPNN 训练框架重新得到的嗜酸蛋白逆折叠设计模型,面向耐酸性蛋白的序列改造任务。训练数据集筛选嗜酸微生物带分泌信号肽的胞外蛋白(规避胞内中性蛋白带来的数据噪声),学习天然耐酸分泌蛋白的序列与理化特征。给定蛋白 PDB 骨架,可输出偏向嗜酸适应特征的候选氨基酸序列。
本工具为计算层面设计工具,输出序列仍需要湿实验验证实际耐酸活性。用户只需上传目标蛋白质的骨架结构,即可获得经嗜酸优化的候选序列,助力您的研发工作。
上传 PDB 或 mmCIF 格式的蛋白质结构文件,系统将自动解析链信息。选择需要设计的链并设置参数后,模型将生成多条优化的氨基酸序列,并给出每条序列的评分(score = -log_prob,越低越好)与序列恢复率。