纽普生物

环形DNA比对工具

对不同物种的同源序列进行比较,是重建物种及其基因组中基因的进化史的重要方法。

环形DNA序列比对工具可以应用在包括质粒、线粒体DNA(mtDNA)、圆形细菌染色体、cccDNA (covalently closed circular DNA)、叶绿体DNA(cpDNA)和其他质体在内的环状核酸分子的序列比对。

1. 输入FASTA格式序列(DNA/RNA,最多100条,不超过1MB):

序列条数:0

字符长度:0

2. 输出格式:

3. 序列类型:

4. 是否显示颜色:

环状DNA

环状DNA包括质粒、cccDNA(病毒在宿主细胞核内所形成的共价闭环DNA)、环状细菌染色体、线粒体DNA、叶绿体DNA在内的环状DNA(circular DNA,circDNA)是线性DNA的表亲,但与后者相比,还处于待了解阶段。

参考文献

Grossi, R., Iliopoulos, C.S., Mercas, R. et al. Circular sequence comparison: algorithms and applications. Algorithms Mol Biol 11, 12 (2016). https://doi.org/10.1186/s13015-016-0076-6