纽普生物

结合能计算亲和力

根据摩尔吉布斯自由能(ΔG,结合自由能)计算亲和力(解离常数Kd或者结合常数Ka)

1. 输入ΔG:

2. 输入温度: K



结合常数

针对反应:R + L ⇌ RL, 我们有Kon[R][L]=Koff[R][L]

那么结合常数Ka = Kon/Koff,Ka的倒数就是解离常数,用Kd表示。Ka和Kd都是用来表征亲和力的参数,Ka越大亲和力越高,Kd越小。

解离常数和摩尔吉布斯自由能(ΔG,结合自由能)之间存在定量关系:ΔG=RTlnKd

298K(25℃)时,ΔG与Kd的关系

ΔG(kcal/mol) Kd(mol/L)
-12 1.56E-09
-11.5 3.64E-09
-11 8.47E-09
-10.5 1.97E-08
-10 4.59E-08
-9.5 1.07E-07
-9 2.49E-07
-8.5 5.79E-07
-8 1.35E-06
-7.5 3.14E-06
-7 7.30E-06
-6.5 1.70E-05
-6 3.95E-05
-5.5 9.20E-05
-5 2.14E-04
-4.5 4.99E-04
-4 1.16E-03