本工具是基于 ProteinMPNN 架构重新训练的逆折叠蛋白设计模型,专门用于耐盐蛋白 / 耐盐酶的计算重设计。模型使用 “salt‑in” 极端嗜盐古菌高质量蛋白组数据集完成训练,可在保留输入蛋白主链骨架前提下,将普通非嗜盐蛋白的序列特征向天然嗜盐蛋白偏移:降低等电点、提升蛋白表面负电荷占比,同时降低表面与蛋白核心的大疏水残基占比,复现嗜盐蛋白特有的氨基酸替换偏好。适用于蓝色生物技术、高盐工业工况下酶的分子改造。
本工具为计算层面设计工具,输出序列仍需要湿实验验证实际耐盐活性。用户只需上传目标蛋白质的骨架结构,即可获得经耐盐优化的候选序列,助力您的研发工作。
上传 PDB 或 mmCIF 格式的蛋白质结构文件,系统将自动解析链信息。选择需要设计的链并设置参数后,模型将生成多条优化的氨基酸序列,并给出每条序列的评分(score = -log_prob,越低越好)与序列恢复率。