在蛋白结晶解析三维结构过程中，求解相位是个必需的步骤。在没有同源结构存在的情况下，硒代甲硫氨基酸标记蛋白是一个常用手段，即通过衍射中的硒代信号从而求得相位信息，进而解出蛋白的三维结构。所以有时候我们从PDB数据库下载得到的结构模型中会含有MSE残基，也就是硒代甲硫氨酸。它不是标准的氨基酸残基，在做分子动力学模拟或者分子对接过程中，Se的存在会经常导致程序报错（很多时候是因为这些程序都没有硒的力场参数）。因此，为了简化一些实际操作，有必要将MSE替换成MET。

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