纽普生物

蛋白酶消化工具

1. 输入蛋白序列:

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2. 选择一种蛋白酶或者试剂:



特异性消化目的蛋白底物

该工具可模拟蛋白质分解酶的水解行为。其主要目的是预测肽类底物的水解结果。

该工具目前为39种酶/试剂建立了消化模型。这种模型有些简单化,因为它们主要是基于正则表达式的,并没有考虑到动力学/温度效应、溶剂可及表面积、二级或三级结构元素等细微的因素。

目前使用的酶/试剂有:

  • Alcalase(碱性内切蛋白酶)
  • Arg-C proteinase(梭菌蛋白酶,精氨酸残基的C末端进行剪切)
  • Asp-N endopeptidase(Asp-N胞内蛋白酶,特异水解Asp的氨基端)
  • Asp-N endopeptidase + N-terminal Glu
  • BNPS-Skatole
  • Caspase1(胱天蛋白酶1)
  • Caspase2(胱天蛋白酶2)
  • Caspase3(胱天蛋白酶3)
  • Caspase4(胱天蛋白酶4)
  • Caspase5(胱天蛋白酶5)
  • Caspase6(胱天蛋白酶6)
  • Caspase7(胱天蛋白酶7)
  • Caspase8(胱天蛋白酶8)
  • Caspase9(胱天蛋白酶9)
  • Caspase10(胱天蛋白酶10)
  • Chymotrypsin(糜蛋白酶)-高特异性 (C-term to [FYW], not before P)
  • Chymotrypsin(糜蛋白酶)-低特异性 (C-term to [FYWML], not before P)
  • Clostripain(梭菌肽酶B)
  • CNBr
  • 肠激酶
  • Factor Xa
  • Formic acid(甲酸)
  • Glutamyl endopeptidase(谷氨酰内肽酶)
  • Granzyme B(颗粒酶B)
  • Hydroxylamine(羟胺)
  • HCl
  • Iodosobenzoic acid(碘苯甲酸)
  • LysC(内切蛋白酶Lys-C,切割赖氨酸的羧基端)
  • LysN(内切蛋白酶Lys-N,切割赖氨酸的氨基端)
  • NTCB (2-nitro-5-thiocyanobenzoic acid)
  • Pepsin (pH1.3)(胃蛋白酶)
  • Pepsin (pH>2)(胃蛋白酶)
  • Proline-endopeptidase(脯氨酰内肽酶)
  • Proteinase K(蛋白酶K,切割脂族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端)
  • Staphylococcal peptidase I(葡萄球菌肽酶I)
  • Thermolysin(嗜热菌蛋白酶)
  • Thrombin(凝血酶)
  • Tobacco etch virus protease(烟草花叶病毒蛋白酶)
  • Trypsin(胰蛋白酶)