真核生物蛋白亚细胞定位预测(ProtLoc)

ProtLoc 是一个面向 真核生物蛋白质序列 的亚细胞定位预测工具。 用户只需输入蛋白质氨基酸序列,即可快速获得 10 类亚细胞定位预测结果和置信度分数,适用于高通量注释、候选蛋白筛选和功能研究前置分析。

1. 蛋白质序列(支持10条 FASTA):

已解析序列数: 0,总残基数: 0



输出类别(10类)

  • Cell membrane
  • Cytoplasm
  • Endoplasmic reticulum
  • Golgi apparatus
  • Lysosome/Vacuole
  • Mitochondrion
  • Nucleus
  • Peroxisome
  • Plastid
  • Extracellular

适用范围

  • 训练数据均为真核生物蛋白质序列
  • 推荐用于真核蛋白定位研究与注释任务
  • 对原核蛋白或分布差异较大的数据,建议谨慎解读

模型性能指标

Test metrics | acc=0.8219 balanced_acc=0.6908 mcc=0.7858

                               precision    recall  f1-score   support

Cell.membrane                    0.7429    0.8681    0.8007       273
Cytoplasm                        0.7079    0.8158    0.7580       505
Endoplasmic.reticulum            0.6797    0.6012    0.6380       173
Golgi.apparatus                  0.7857    0.3143    0.4490        70
Lysosome/Vacuole                 0.5405    0.3125    0.3960        64
Mitochondrion                    0.8986    0.8510    0.8741       302
Nucleus                          0.8950    0.8672    0.8809       806
Peroxisome                       0.9286    0.4333    0.5909        30
Plastid                          0.9184    0.8882    0.9030       152
Extracellular                    0.8931    0.9567    0.9238       393

accuracy                                             0.8219      2768
macro avg                        0.7991    0.6908    0.7215      2768
weighted avg                     0.8232    0.8219    0.8167      2768
micro avg                        0.8219    0.8219    0.8219      2768