我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来，主要是为了方便研究工作，其中一小部分质粒进行了质量控制，可供科学家使用。
所有的产品都严格仅供科学研究使用，不能应用于临床试验，包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。
确保质粒的关键元件正确，但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列，可能与测序结果不一致，请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序，本页面一般会提供下载)
开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%，则将其视为正确。
由于科学研究是在探索未知，具有很大的不确定性，在任何情况下，我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。
- 载体名称:
- pDSK-mCherry
- 载体抗性:
- Kana
- 载体长度:
- 9764 bp
- 载体类型:
- Protein expression
- 载体来源:
- NovoPro
- 拷贝数:
- Low copy number
- 启动子:
- RSF1010 oriV
- 感受态:
- Top10
- 培养温度:
- 37℃
pDSK-mCherry 载体图谱
质粒操作方法
1. 发货形式：质粒干粉(常温运输，存于-20度，请务必先转化提质粒后使用)
2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min，再加入20μl ddH2O溶解质粒;（质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大，这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致，因此建议先转化提质粒后再使用）
3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min，加入2μl质粒，再冰浴30min后，42℃热激60s，不要搅动，再冰浴2min；
4. 加入900μl无抗的LB液体培养基，180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);
5. 6000rpm离心5min，仅留100μl上清液重悬细菌沉淀，并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;
6. 将平板倒置37℃培养14h，如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化；没有菌落则加入10μl质粒转化；建议不要直接转表达感受态， 要先转克隆感受态，重提质粒后再导入表达感受态);
7. 挑取单菌落至LB液体培养基中，加入对应抗生素，220rpm震荡培养14h，根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
pDSK-mCherry 载体序列
LOCUS Exported 9764 bp DNA circular SYN 27-SEP-2024
DEFINITION synthetic circular DNA
ACCESSION .
VERSION .
KEYWORDS pDSK-mCherry
SOURCE synthetic DNA construct
ORGANISM synthetic DNA construct
REFERENCE 1 (bases 1 to 9764)
AUTHORS .
TITLE Direct Submission
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..9764
/mol_type="other DNA"
/organism="synthetic DNA construct"
primer_bind 1079..1095
/label=M13 fwd
/note="common sequencing primer, one of multiple similar
variants"
RBS 1314..1336
/note="efficient ribosome binding site from bacteriophage
T7 gene 10 (Olins and Rangwala, 1989)"
CDS 1344..2054
/codon_start=1
/product="monomeric derivative of DsRed fluorescent protein
(Shaner et al., 2004)"
/label=mCherry
/note="mammalian codon-optimized"
/translation="MVSKGEEDNMAIIKEFMRFKVHMEGSVNGHEFEIEGEGEGRPYEG
TQTAKLKVTKGGPLPFAWDILSPQFMYGSKAYVKHPADIPDYLKLSFPEGFKWERVMNF
EDGGVVTVTQDSSLQDGEFIYKVKLRGTNFPSDGPVMQKKTMGWEASSERMYPEDGALK
GEIKQRLKLKDGGHYDAEVKTTYKAKKPVQLPGAYNVNIKLDITSHNEDYTIVEQYERA
EGRHSTGGMDELYK"
primer_bind complement(2103..2119)
/label=M13 rev
/note="common sequencing primer, one of multiple similar
variants"
protein_bind 2127..2143
/label=lac operator
/bound_moiety="lac repressor encoded by lacI"
/note="The lac repressor binds to the lac operator to
inhibit transcription in E. coli. This inhibition can be
relieved by adding lactose or
isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside (IPTG)."
promoter complement(2151..2181)
/label=lac promoter
/note="promoter for the E. coli lac operon"
protein_bind 2196..2217
/label=CAP binding site
/bound_moiety="E. coli catabolite activator protein"
/note="CAP binding activates transcription in the presence
of cAMP."
CDS complement(3719..4558)
/codon_start=1
/gene="repA"
/product="replication protein A of the broad-host-range
plasmid RSF1010 (Scholz et al., 1989)"
/label=RSF1010 RepA
/translation="MATHKPINILEAFAAAPPPLDYVLPNMVAGTVGALVSPGGAGKSM
LALQLAAQIAGGPDLLEVGELPTGPVIYLPAEDPPTAIHHRLHALGAHLSAEERQAVAD
GLLIQPLIGSLPNIMAPEWFDGLKRAAEGRRLMVLDTLRRFHIEEENASGPMAQVIGRM
EAIAADTGCSIVFLHHASKGAAMMGAGDQQQASRGSSVLVDNIRWQSYLSSMTSAEAEE
WGVDDDQRRFFVRFGVSKANYGAPFADRWFRRHDGGVLKPAVLERQRKSKGVPRGEA"
CDS complement(5069..6040)
/codon_start=1
/gene="repB"
/product="replication protein B of the broad-host-range
plasmid RSF1010 (Scholz et al., 1989)"
/label=RSF1010 RepB
/translation="MKNDRTLQAIGRQLKAMGCERFDIGVRDATTGQMMNREWSAAEVL
QNTPWLKRMNAQGNDVYIRPAEQERHGLVLVDDLSEFDLDDMKAEGREPALVVETSPKN
YQAWVKVADAAGGELRGQIARTLASEYDADPASADSRHYGRLAGFTNRKDKHTTRAGYQ
PWVLLRESKGKTATAGPALVQQAGQQIEQAQRQQEKARRLASLELPERQLSRHRRTALD
EYRSEMAGLVKRFGDDLSKCDFIAAQKLASRGRSAEEIGKAMAEASPALAERKPGHEAD
YIERTVSKVMGLPSVQLARAELARAPAPRQRGMDRGGPDFSM"
oriT 7279..7366
/label=RSF1010 oriT
/note="origin of transfer of the broad-host-range plasmid
RSF1010 (Scholz et al., 1989)"
rep_origin 7708..8102
/label=RSF1010 oriV
/note="replication origin of the broad-host-range plasmid
RSF1010; requires the RSF1010 RepA/B/C proteins for
replication (Scholz et al., 1989)"
CDS complement(8916..9731)
/codon_start=1
/gene="aph(3')-Ia"
/product="aminoglycoside phosphotransferase"
/label=KanR
/note="confers resistance to kanamycin in bacteria or G418
(Geneticin(R)) in eukaryotes"
/translation="MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYG
KPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGK
TAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDA
SDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGI
ADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF"