我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来,主要是为了方便研究工作,其中一小部分质粒进行了质量控制,可供科学家使用。
所有的产品都严格仅供科学研究使用,不能应用于临床试验,包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。
确保质粒的关键元件正确,但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列,可能与测序结果不一致,请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序,本页面一般会提供下载)
开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%,则将其视为正确。
由于科学研究是在探索未知,具有很大的不确定性,在任何情况下,我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。
- 载体名称:
- PB-U6-DR-SgRNA-DR-EF1a-mCherry-SV40
- 载体抗性:
- Ampicillin, Kanamycin
- 载体长度:
- 6255 bp
- 载体类型:
- Gene-editing vector
- 复制子:
- ori
- 宿主:
- Mammalian cells
- 启动子:
- U6, EF1a
- 5'引物:
- U6-F
- 感受态:
- Stable
- 培养温度:
- 37℃
PB-U6-DR-SgRNA-DR-EF1a-mCherry-SV40 载体图谱
质粒操作方法
1. 发货形式:质粒干粉(常温运输,存于-20度,请务必先转化提质粒后使用)
2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min,再加入20μl ddH2O溶解质粒;(质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大,这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致,因此建议先转化提质粒后再使用)
3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min,加入2μl质粒,再冰浴30min后,42℃热激60s,不要搅动,再冰浴2min;
4. 加入900μl无抗的LB液体培养基,180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);
5. 6000rpm离心5min,仅留100μl上清液重悬细菌沉淀,并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;
6. 将平板倒置37℃培养14h,如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化;没有菌落则加入10μl质粒转化;建议不要直接转表达感受态, 要先转克隆感受态,重提质粒后再导入表达感受态);
7. 挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220rpm震荡培养14h,根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
PB-U6-DR-SgRNA-DR-EF1a-mCherry-SV40 载体序列
LOCUS . 6255 bp DNA circular UNK 01-JAN-1980 DEFINITION synthetic circular DNA. ACCESSION VERSION KEYWORDS . SOURCE . ORGANISM . . FEATURES Location/Qualifiers protein_bind 105..126 /label="CAP binding site" /note="CAP binding activates transcription in the presence of cAMP." promoter 141..171 /label="lac promoter" /note="promoter for the E. coli lac operon" protein_bind 179..195 /label="lac operator" /note="The lac repressor binds to the lac operator to inhibit transcription in E. coli. This inhibition can be relieved by adding lactose or isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside (IPTG)." primer_bind 203..219 /label="M13 rev" /note="common sequencing primer, one of multiple similar variants" promoter 593..833 /label="U6 promoter" /note="RNA polymerase III promoter for human U6 snRNA" misc_RNA 843..878 /label="RfxCas13d DR36" /note="36-base direct repeat for an RfxCas13d pre-gRNA (Konermann et al., 2018)" promoter 1003..1214 /label="EF-1α core promoter" /note="core promoter for human elongation factor EF-1α" LTR 1227..1495 /label="5' LTR (truncated)" /note="truncated 5' long terminal repeat (LTR) from human T-cell leukemia virus (HTLV) type 1" CDS 1529..2236 /label="mCherry" /note="monomeric derivative of DsRed fluorescent protein (Shaner et al., 2004)" polyA_signal 2240..2361 /label="SV40 poly(A) signal" /note="SV40 polyadenylation signal" promoter complement(2687..2705) /label="T7 promoter" /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase" primer_bind complement(2712..2728) /label="M13 fwd" /note="common sequencing primer, one of multiple similar variants" rep_origin 2869..3297 /label="f1 ori" /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow indicates direction of (+) strand synthesis" CDS 3641..4432 /label="NeoR/KanR" /note="aminoglycoside phosphotransferase" CDS 4453..5310 /label="AmpR" /note="β-lactamase" rep_origin 5484..6072 /label="ori" /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of replication"