我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来，主要是为了方便研究工作，其中一小部分质粒进行了质量控制，可供科学家使用。
所有的产品都严格仅供科学研究使用，不能应用于临床试验，包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。
确保质粒的关键元件正确，但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列，可能与测序结果不一致，请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序，本页面一般会提供下载)
开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%，则将其视为正确。
由于科学研究是在探索未知，具有很大的不确定性，在任何情况下，我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。
- 载体名称:
- pAgc-A3-bgyg-3'N
- 载体抗性:
- Ampicillin
- 载体长度:
- 10891 bp
- 载体类型:
- Reporter vector
- 复制子:
- ori
- 载体来源:
- Ikeda Y, Ito K, Izumi Y, Shinomura T.
- 启动子:
- SP6
pAgc-A3-bgyg-3'N 载体图谱
质粒操作方法
1. 发货形式：质粒干粉(常温运输，存于-20度，请务必先转化提质粒后使用)
2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min，再加入20μl ddH2O溶解质粒;（质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大，这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致，因此建议先转化提质粒后再使用）
3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min，加入2μl质粒，再冰浴30min后，42℃热激60s，不要搅动，再冰浴2min；
4. 加入900μl无抗的LB液体培养基，180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);
5. 6000rpm离心5min，仅留100μl上清液重悬细菌沉淀，并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;
6. 将平板倒置37℃培养14h，如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化；没有菌落则加入10μl质粒转化；建议不要直接转表达感受态， 要先转克隆感受态，重提质粒后再导入表达感受态);
7. 挑取单菌落至LB液体培养基中，加入对应抗生素，220rpm震荡培养14h，根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
pAgc-A3-bgyg-3'N 载体序列
LOCUS 40924_4115 10891 bp DNA circular SYN 17-DEC-2018
DEFINITION Reporter vector pAgc-A3-bgyg-3'N DNA, complete sequence.
ACCESSION .
VERSION .
KEYWORDS .
SOURCE synthetic DNA construct
ORGANISM synthetic DNA construct
REFERENCE 1 (bases 1 to 10891)
AUTHORS Ikeda Y, Ito K, Izumi Y, Shinomura T.
TITLE A candidate enhancer element responsible for high-level expression
of the aggrecan gene in chondrocytes
JOURNAL J. Biochem. 156 (1), 21-28 (2014)
PUBMED 24554731
REFERENCE 2 (bases 1 to 10891)
AUTHORS Ikeda Y, Shinomura T.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (01-AUG-2013) Contact:Yuichi Ikeda Tokyo Medical and
Dental University, Tissue Regeneration; 1-5-45 Yushima, Bunkyo-ku,
Tokyo 113-8549, Japan URL :http://www.tmd.ac.jp/
REFERENCE 3 (bases 1 to 10891)
TITLE Direct Submission
REFERENCE 4 (bases 1 to 10891)
AUTHORS .
TITLE Direct Submission
COMMENT SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: "J.
Biochem."; date: "2014"; volume: "156"; issue: "1"; pages: "21-28"
COMMENT SGRef: number: 2; type: "Journal Article"; journalName: "Submitted
(01-AUG-2013) Contact:Yuichi Ikeda Tokyo Medical and Dental
University, Tissue Regeneration; 1-5-45 Yushima, Bunkyo-ku, Tokyo
113-8549, Japan URL :http://www.tmd.ac.jp/"
COMMENT SGRef: number: 3; type: "Journal Article"
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..10891
/mol_type="other DNA"
/organism="synthetic DNA construct"
regulatory 18..546
/gene="bgyg"
/label=rat Agc1 promoter sequence
/note="rat Agc1 promoter sequence"
/regulatory_class="promoter"
misc_binding 1511..1786
/gene="bgyg"
/label=SOX9 binding site
/bound_moiety="SOX9"
/note="A3"
CDS 2678..5719
/label=lacZ
/note="beta-galactosidase"
CDS 5735..6769
/label=HygR
/note="hygromycin B phosphotransferase"
promoter complement(7760..7778)
/label=SP6 promoter
/note="promoter for bacteriophage SP6 RNA polymerase"
primer_bind complement(7796..7812)
/label=M13 rev
/note="common sequencing primer, one of multiple similar
variants"
protein_bind 7820..7836
/label=lac operator
/bound_moiety="lac repressor encoded by lacI"
/note="The lac repressor binds to the lac operator to
inhibit transcription in E. coli. This inhibition can be
relieved by adding lactose or
isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside (IPTG)."
promoter complement(7844..7874)
/label=lac promoter
/note="promoter for the E. coli lac operon"
protein_bind complement(7889..7910)
/label=CAP binding site
/note="CAP binding activates transcription in the presence
of cAMP."
rep_origin complement(8198..8786)
/direction=LEFT
/label=ori
/note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
replication"
CDS complement(8960..9817)
/label=AmpR
/note="beta-lactamase"
promoter complement(9818..9922)
/label=AmpR promoter
rep_origin 10256..10711
/direction=RIGHT
/label=f1 ori
/note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow
indicates direction of (+) strand synthesis"
primer_bind 10852..10868
/label=M13 fwd
/note="common sequencing primer, one of multiple similar
variants"