纽普生物

抗体序列编号

对抗体氨基酸序列进行编号;对输入的序列进行鉴定,分辨免疫球蛋白(IG)还是T细胞受体(TR);编号系统有:IMGT, Chothia, Kabat, Martin (扩展版Chothia) 及AHo;TR序列只能用IMGT或者AHo进行编号。如需对抗体可变区的CDR和FR进行标注,请使用抗体可变区CDR标注工具

1. 输入单条蛋白序列(非FASTA格式):

全长:0

2. 选择编号系统:

3. 指定蛋白类型:

4. 指定蛋白种属:

抗体/T细胞受体可变区编号

支持小鼠,大鼠,人,羊驼,兔,恒河猴,猪的抗体/T细胞受体可变区编号

能够识别的链有:免疫球蛋白:重链,轻链(Kappa,Labmda);T细胞受体:α链和β链(γ和δ不识别)

支持的编号系统有:IMGT,Kabat,Chothia,Martin,AHo。

IMGT: 共128位,支持IG/TR,位置插入用数字加字母表示。

Kabat:只能用于抗体的轻重链识别,位置插入用数字加字母表示。

Chothia:只能用于抗体的轻重链识别,位置插入用数字加字母表示。与Kabat不同的是CDRH1插入位置的注释不同

Martin:Chothia的增强版,对插入位置进行了进一步的结构修正

AHo:共149位,支持IG/TR

参考文献

Dunbar J, Deane CM. ANARCI: antigen receptor numbering and receptor classification. Bioinformatics. 2016;32(2):298-300