RNA聚合酶Pol III独特地转录小的非编码RNAs，包括5S rRNA（1型）、tRNAs（2型）和其他一些小RNAs（3型），如U6 snRNA。Pol III启动子可以分成三类：类型1、类型2和类型3。其中类型1和类型2启动子位于转录起点的下游，它们分别转录5S rRNA和tRNA，类型3启动子则位于转录起点的上游。 在转录起点下游的类型1启动子包含boxA和boxC两个核心元件；在转录起点下游的类型2启动子则包含boxA和boxB两个核心元件；而在转录起点...

ColabDesign利用了一些先进的深度学习模型来进行蛋白质结构的预测和设计。这些模型主要包括： AlphaFold：这是一个由DeepMind开发的大规模机器学习系统，可以在没有任何实验数据的情况下预测蛋白质结构。AlphaFold在CAS（Critical assessment of Structure Prediction）比赛中表现卓越，是目前最先进的蛋白质折叠预测模型。 RoseTT...

核素标记靶向肽常用螯合剂1. DOTA原名：1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4,7,10-tetraacetic acid（1,4,7,10-四氮杂环十二烷-1,4,7,10-四乙酸）分子结构：                                      &nb...

根据其结构，去垢剂可大致分为：离子型、两性型和非离子型。 离子型去垢剂含有阴离子或阳离子头基，并带有净电荷。离子型去垢剂胶束的大小由侧链的疏水吸引力和离子基团的排斥力共同决定。因此，随着反离子浓度的增加，头基团上的电荷被中和，胶束体积就会增大。胶束尺寸也会随着烷基链长度的增加而增大。离子型去垢剂在溶解膜蛋白方面非常有效，但几乎总是会在一定程度上使得蛋白质变性。 非离子型去垢剂含有不带电的亲水性头基，由聚氧乙烯分子或糖苷基团组成。由于非离子去污剂能打破脂质-脂质和...

1 AAV简介 1.1 野生型AAV病毒 腺相关病毒（Adeno-associated viruse，AAV）载体是以AAV 基因组为骨架改造而来的基因递送工具。腺相关病毒属于细小病毒科的低致病性病毒，它的基因组为线性单链DNA，大小约 4.7 kB，在基因组两端分别有一条反向末端重复序列（Inverted terminal repeat，ITR），与病毒基因组高效释放、选择性复制和包装密切相关，基因组编码区有2个开放阅读框，分别编码4种Rep 蛋白和3种Cap...

今天给大家介绍是Nature Structural & Molecular Biology上的一篇文章correspondence “Can AlphaFold2 predict the impact of missense mutations on structure?”。 AlphaFold2实现了从氨基酸序列预测蛋白质结构的目标，这是一个里程碑式的成就。虽然AF2的结构预测算法能够准确预测野生型(wild-type,WT)结构，但在预测错义突变对...

生物体中的RNA种类繁多，功能复杂，一般按照是否编码蛋白质将其分为编码RNA（coding RNA）和非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）两大类。前者就是指mRNA，后者则包括很多种类，如众所周知的tRNA和rRNA，参与mRNA剪接的snRNA，参与RNA修饰的snoRNA等。 非编码RNA种类很多，按照长度可分为两大类：大于200 nt（核苷酸）的称为长非编码RNA（lncRNA），小于200 nt的称为小非编码RNA（small ncRNA），5...

强悍的结构预测软件AlphaFold2已经开源，程序代码部分基本可以随意使用包括分发、修改等，深度学习的模型不得用于商业化用途，对学术界来说是个重磅利好。 AlphaFold2开源地址：https://github.com/deepmind/alphafold AlphaFold2预测的结构数据库：https://www.alphafold.ebi.ac.uk/ 安装过程大致如上面那个网址描述的一般。网上也有更详细的教程： ...

BRAVAIS- POSSIBLE SPACE-GROUPS FOR PROTEIN CRYSTALS TYPE [SPACE GROUP NUMBER,SYMBOL] aP [1,P1] mP [3,P2] [4,P2(1)] mC,mI [5,C2] oP [16,P222] [17,P222(1)] [18,P2(1)2(1)2] [19,P2(1)2(1)2(1)] oC ...

>小鼠 IgG1 (P01868-1) AKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSPRPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVY...