文章资讯

显性负性结构域的特征、典型类型及应用设计原则

显性负性结构域是蛋白质中一类特殊的结构或功能区域,当以突变体或截短形式表达时,可通过争夺结合伴侣(如二聚化)或底物等方式,抑制细胞内野生型(正常版本)蛋白质的活性。其抑制作用具有 “显性” 特征 —— 即便细胞内存在内源性野生型蛋白质,仅表达该突变结构域就能干扰野生型蛋白的功能,无需删除野生型基因。典型示例肿瘤抑制蛋白 p53:需形成四聚体才能发挥作用,突变 p53(含显性负性结构域 p53DD,即小鼠 p53 (NM_011640) 删除 40-903 位氨基酸)会与野生型 p53 亚基结合,...

查看详情

circRNA 翻译:机制、调控与蛋白表达

环状 RNA(circRNA)是一类具有共价闭合单链结构的非编码 RNA,在很长一段时间内被认为不具备蛋白编码潜力。然而,近年来的大量研究证实,部分 circRNA 可突破传统认知,通过内部核糖体进入位点(IRES)等非帽依赖机制启动翻译过程,生成具有生物学功能的蛋白质或多肽,这一发现为 RNA 功能研究及生物制药领域开辟了新的方向。 一、circRNA 的生物发生与分子特征 (一)核心生成机制 circRNA 的生成途...

查看详情

革兰氏阳性与阴性菌中 Sigma 因子及启动子的特性与差异

一、细菌 RNA 聚合酶的结构与功能基础 细菌 RNA 聚合酶(RNAP)负责将 DNA 转录为 RNA,是基因表达的关键起始步骤。其核心酶在革兰氏阳性菌和阴性菌中均由五个亚基组成,即 ββ′α₂ω 。核心酶虽能非特异性结合 DNA,并从 DNA 末端或缺口起始 RNA 合成,但无法识别启动子,需与 sigma 因子结合形成全酶(α₂ββ′σω)才能启动特异性转录。其中,β 亚基参与核苷酸底物结合,β′亚基负责与 DNA 模板结合,α 亚基在酶组装及与调控蛋白互作中...

查看详情

Cell 重磅:BHB 次级代谢途径产物 BHB-Phe 可抑制食欲减轻肥胖

哺乳动物进化出复杂的营养响应途径,将外部能量来源与内部代谢稳态相联系,其中 β-羟基丁酸(BHB)是一种关键代谢物,其水平在碳水化合物供应不足时升高,如饥饿、间接性禁食、生酮饮食或运动之后。这引发了人们对研究BHB在肥胖中的潜在应用的兴趣。 近期,贝勒医学院徐勇教授团队与斯坦福大学 Jonathan Z. Long 教授团队合作,在 Cell 期刊发表了题为:A β-hydroxybutyrate shunt pathway...

查看详情

逆转录病毒和慢病毒区别及逆转录病毒包装

慢病毒和逆转录病毒均属于逆转录病毒科。慢病毒是逆转录病毒的一种,它之所以称为慢病毒,是因为这些病毒具有长达数年的潜伏期,其中人HIV,猴SIV,猫FIV都是慢病毒。 慢病毒和逆转录病毒典型特征为其 RNA 基因组能逆转录为 cDNA 副本,cDNA 副本又能稳定整合至宿主细胞基因组中(这就是常说的稳转)。逆转录病毒通常分两种:简单的(如γ-逆转录病毒,如MMLV、MSCV等)和复杂的(如慢病毒)。当科学家们讨论逆转录病毒时,他们通常指的是γ-逆转录病毒。 图1. 逆转录病毒的结...

查看详情

基因表达的开关——CreERT

在特定时间、特定细胞类型中有效引入体细胞突变对基因功能的研究非常重要。通过将 Cre 重组酶与人类雌激素受体(ER)的突变配体结合域(LBD)融合,得到了他莫昔芬依赖的 Cre 重组酶 CreERT。 CreERT 是一种融合蛋白,由人雌激素受体(ER)的突变配体结合域与 Cre 重组酶组成。它的活性可以由 4-羟基-他莫昔芬(OHT)诱导,但不受天然 ER 配体的影响。 在他莫昔芬诱导的 Cre-ERT 系统中,融合的 Cre 蛋白(CreER)正常情况下在细...

查看详情

基因表达的开关——四环素调控系统

四环素调控系统的来源和原理四环素阻遏蛋白(TetR)/操纵子(TetO)是大肠杆菌在遇到四环素时激活四环素解毒的天然机制。在没有四环素的情况下,TetR 会表达并形成同源二聚体,并以高亲和力与两个四环素操作端 tetO1 和 tetO2 结合,这导致四环素外排转运体 TetA 转录和翻译受抑制。如果存在四环素,它就会通过细胞膜扩散,并可逆地抑制氨基酰-tRNA 与 mRNA 核糖体的结合,从而阻碍蛋白质的生物合成。当存在 Tet 系统时,四环素与 Mg2+ 形成复合物(红色三角形)。该复合物与 ...

查看详情

内含子与外显子捕获

RNA 剪接(RNA splicing)是真核生物 RNA 转录后加工的必要环节,是导致转录组多样性和复杂性的关键步骤。真核细胞的基因序列中,包含了内含子(intron)与外显子(exon),两者交互穿插。其中内含子在基因转录成mRNA前体后会被RNA剪接体移除,剩下的外显子才是能够存在于成熟mRNA(之后再进一步翻译成蛋白质)的片段。 为了明确细胞核内含子剪接的分子机制,我们必须清楚剪接位点的特点。通过比较mRNA和相应结构基因的核苷酸序列,发现内含子的两端之间并没有很强...

查看详情

化学遗传学技术之DREADD

化学遗传学是指通过对生物大分子实行改造,使其能和先前无法识别的小分子进行相互作用,从而达到可控和可逆地(伴随加入或除去化合物而启动或中断特定的反应)控制生物大分子的活性,进而特异性地影响生理活动。 化学遗传学技术已经在信号转导、药物开发、功能基因组学等方面的研究中得到了广泛的应用。只由特定药物激活的受体(Designer receptors exclusively activated by designer drugs,DREADDs)技术是目前应用最广泛的化学遗传学技术,...

查看详情

农杆菌质粒载体系统

在过去的几十年,科学家们一直在使用农杆菌介导的基因转化技术来培育转基因植物。最开始的时候,将感兴趣的基因(GOI)引入 T-DNA 的技术涉及复杂的微生物遗传方法,但 1983 年两个小组的突破性发现使得 T-DNA 和 vir 基因区域可以被分割到两个独立的复制子上,形成了 T-DNA 二元系统,该系统便于对农杆菌进行操作,促进了植物基因工程的发展。 提到T-DNA,就不得不提Ti 质粒和 Ri 质粒。Ti质粒存在于根癌农杆菌(Agrobacterium tume...

查看详情