酶活性位点催化残基特征分析
Bartlett等人分析了178个酶(有结构报道)及他们的催化残基特征,并总结成文。催化残基定义:1. 直接参与催化,比如作为亲核试剂的残基.2. 对另外一个直接参与催化的残基或者水分子施加影响的残基(例如静电或者酸碱作用)。3. 稳定过渡态中间体的残基。4. 对底物或者辅因子施加影响,从而辅助催化。比如极化作用。平均每个酶有3.5个催化残基。残基的分布频率及所在的二级结构特征在所有催化残基中,有65%的残基是带电氨基酸(H, R, K, E, D),有27%的残基是极性氨基酸(Q, T, S,...
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