核酸序列的检索实验
掌握核酸序列检索的操作方法;熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义;了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义; 熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存; 1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC060830和NM_000230,连接提取该序列内容,阅读序列格式的解释,理解其含义; 2. GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存; 3. ...
查看详情掌握核酸序列检索的操作方法;熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义;了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义; 熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存; 1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC060830和NM_000230,连接提取该序列内容,阅读序列格式的解释,理解其含义; 2. GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存; 3. ...
查看详情熟练掌握上网搜索生物信息学数据库和软件的方法及技能。 一、搜索生物信息学数据库或者软件 数据库是生物信息学的主要内容,各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。 核酸序列数据库有GenBank, EMBL, DDB等, 蛋白质序列数据库有SWISS-PROT, PIR,OWL, NRL3D, TrEMBL等, 蛋白质片段数据库有PROSITE, BLO...
查看详情1、将1.5 ml培养液倒入eppendorf管中,4 ℃下12000g离心30秒。 2、弃上清,将管倒置于卫生纸上几分钟,使液体流尽。 3、将菌体沉淀悬浮于120 ml STET溶液中, 涡旋混匀。 4、加入10 ml新配制的溶菌酶溶液(10 mg/ml), 涡旋振荡3秒钟。 5、将eppendorf管放入沸水浴中,50秒后立即取出...
查看详情1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2 ml LB培养基。 2、37 ℃振荡培养过夜。 3、取1.5 ml菌体于Ep管,以4000 rpm离心3 min,弃上清液。 4、加0.l ml溶液I(1%葡萄糖,50 mM/L EDTA pH8.0,25 mM/L Tris-HCl pH8.0)充分混合。 5、加入0.2 ml溶液 II(0.2 mM/L NaOH...
查看详情基因芯片(Gene Chip,DNA Chip),又称DNA微阵列(DNA Micorarray),是指按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下,载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记,在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号。 基因芯片基本技术流程图 一、基因芯片技术步骤 基因芯片技术主要包括四个主要步骤:芯片制备、样品...
查看详情1. 用PBS分别洗涤两次60 mm 培养皿中的转染β-半乳糖苷酶表达质粒的细胞及模拟转染的细胞。 2. 加入250 μl Triton裂解液,用一橡胶细胞刮子将细胞刮下来。将细胞提取物转移至1 个1.5 ml 微量离心管中。在4℃以最大速度离心2 min,将上清转移至一个干净的微量离心管中。 3. 在一只发光计的测试管中加2~20 μl 细胞提取液。再加200 μl β-半乳糖苷酶反应缓冲液,在室温下温育60 m...
查看详情植物体内水分的运输主要通过木质部导管和管胞,这两类细胞都是死细胞。当蒸腾强烈时, 水分运输的动力主要来自叶片的蒸腾拉力,在切去根的情况下更是如此。因此,当把离体的叶片或枝条插入有色溶液中时,液体便迅速被吸入导管并沿导管运输,可以利用液体的颜色指示运输途径,并可以大致计算出运输速度。 1. 10 ml平底指形管中倒入约5 ml红墨水,然后选择一片萝卜叶子,将叶面上的水擦干,用刀片从叶柄基部将叶子切下,迅速插入红墨水中,将叶子对着光亮处观察,可以清晰地看见红墨水沿...
查看详情植物在正常生长的状况下,从叶的尖端或边沿叶脉终止部位的水孔排出水滴,这种现象称 吐水,这是一种由根压产生的正常的生理现象。外界环境条件如温度、湿度、土壤溶液水势、有毒物质等,都会影响到植物根系的生命活动,从而也影响植物吐水活动。 1. 水稻幼苗培养 选取水稻种子,经浸种后在适宜温度下催芽,然后播入培养皿中,光下培养4-5d,待幼苗长至3-4cm高,备用。 2. 实验前准备 取5盆生长...
查看详情染色体结构变异主要有缺失、重复、倒位、易位四种。其发生过程是由于同源染色体或非同源染色体之间发生断裂,然后发生错误重接的结果。各种结构变异的杂合体,在细胞分裂过程中常常表现不正常的细胞学行为,可以进行细胞学鉴定。在减数分裂过程粗线期,可以观察到缺失杂合体的“缺失环”,重复杂合体的染色体突出的环或瘤,倒位杂合体的“倒位圈”或者后期的染色体桥,易位杂合体的“十字形”联合或者终变期“四体环”“四体链”“8字形环”。在有丝分裂细胞中可见到后期的染色体桥,染色体断片,以及间期的细胞核显出现“...
查看详情植物染色体数目一般为二倍体(2n),但是在自然条件下和人工条件下可以诱发染色体数目的变异。染色体数目变异分为整倍性变异和非整倍性变异。整倍性变异有同源多倍体变异和异源多倍体变异。非整倍性变异有单体、缺体、三体、四体等。由于染色体数目的变异可以导致有丝分裂和减数分裂过程出现不正常的细胞学行为以及形态特征的变化。 人工诱导多倍体的方法很多。用秋水仙碱诱发多倍体是常用而且是最有效方法。秋水仙碱是从秋水仙(Colchium autumnale. L.)器官和种子的提炼出来的一种植物碱,其化...
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