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RNAStructure使用方法:打造五星级RNA二级结构

作者:解螺旋.子非鱼 RNA自从在中心法则中占有一席之位以后,大家就开始争相热捧。RNA的单链性质导致它与DNA不同,分子中的一部分核苷酸可与其他部分的核苷酸互相配对,即RNA可产生折叠。我们知道生物分子的功能与结构是密切相关的,折叠的RNA能部分甚至完全解释RNA分子的功能。对于当前的三维结构还是过于复杂,所以我们主要专注于二级结构的预测。有关二级结构的预测,小鱼今天就为大家介绍一款性价比极高的软件:RNAStructure。RNAStructure利用 Zuker算法(Zuker Al...

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免疫调节:邪恶的TH17细胞也有善良的一面

作者:解螺旋大厨 摘要:免疫炎症反应的主要贡献在于机体对抗外界的感染,但同时也可因为反应失调而导致免疫性疾病的产生。TH17细胞,作为辅助T细胞(TH)家族中的一员,就可导致人类产生严重的免疫性疾病,这样看来TH17是不是一个恶人呢?Cell, Volume 151, Issue 2, p289-303TH17细胞在体外刺激时很不稳定,并具有可塑性,比如:停止表达自身标志性细胞因子IL-17A并开始表达其他细胞谱系的标志性细胞因子等。由于技术方法的局限性,很难检测离体免疫反应时TH17细胞在...

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【文献精读】胰岛素抵抗的分子机制

背景介绍临床现象:干扰素调节因子IRF4在脂肪细胞脂代谢的过程中起重要作用,但在脂肪组织巨噬细胞(ATM)中的作用并不清楚。科学问题:IRF家族分子IRF4是否调控了ATM的功能?分子机制研究切入点:根据是否促进炎症反应,可将巨噬细胞分为M1型和M2型。M1型巨噬细胞分泌IL-1b、TNF-a等促炎分子,而M2型巨噬细胞分泌IL-10等抑炎因子。如果M1型巨噬细胞在脂肪组织中大量聚集,则会引起胰岛素抵抗和代谢功能失调,而M2型则相反。本文从巨噬细胞的两种分型入手,对分子机制进行了解释。研究...

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学统计必看:你真的懂p值吗?

来源:协和八 作者:张之昊面对文献里五花八门的统计学名词、层出不穷的测试和模型,你是否后悔当年的统计课上不该睡大觉?辛辛苦苦做了实验收了数据,正想大步迈向SCI高分文章,你是否不知数据分析该如何下手?投出了文稿,却等来了审稿人对统计方法似是而非的挑刺,你是否不清楚该如何应对?别担心,你不是一个人在战斗!我们将指出常见的统计学误区和陷阱,回答那些你一直想问但不好意思问的问题。还会在统计学表面的芜杂之中为你阐明最本质的思维方法。我们的目标是,让你拥有一双善用统计学的巧手,和一双能辨清滥用统计学的...

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向mTOR的肿瘤治疗

作者:解螺旋.蛋炒饭mTOR在肿瘤发生中起到重要的作用,Rapamycin是经典的mTOR的抑制剂,理论上说,上面那么抑制住它的活性不是可以很好的限制肿瘤了吗?其实不然,下面的一个负反馈的图就很好的说明了这个原因。当mTOR被长期抑制后,S6K1的活性也会降低,S6K1对RTK的反馈抑制回路就会被解除,那么,将会有更多的补偿回路来补偿AKT和AGKs这些促进生存的因子,此外S6K1还可以抑制MEK-ERK信号通路,同样rapamycin可以解除对MEK-ERK的抑制,抑制临床上表现为Rapam...

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Winplas 2.7使用方法:教你画质粒载体图

Winplas2.7作为质粒绘图的专业软件,文件很小,最主要是简单易学,可以在知道或不知道序列结构的情况下绘制质粒图。利用Winplas绘制质粒图,这不但让你顺利完成工作,还可通过绘画绚丽多彩的质粒图来放松心情。(竟有这等好事!) 在不知道序列结构时绘制质粒图(白手起家虽然辛苦,但享受过程才能体会这里面的乐趣!)1、点击“文件”菜单中新建命令,出现MapView窗口,同时工具栏中地绘图命令显亮。2、点击“插入-空片断”命令,出现一个“创建新质粒”对话框。,在“标题栏”中填入质粒名称,在“碱基对...

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肿瘤转不转移,粘附分子说了算

作者:解螺旋.流氓兔 转移是肿瘤主要的恶性表现 俗话说,饱暖思淫欲,肿瘤君从出生开始(原发癌生长),解决了吃饭的问题(肿瘤血管生成),就开始疯狂的繁殖后代!当肿瘤君生子、子又生孙、孙又生子、子子孙孙无穷尽的时候,就寻思开拓新的领地,意味着它得挣脱束缚去远行。世界那么大,总得去看看,对不对?而这种远距离的航行,遇到新的陆地生根发芽(转移),将导致机体陷入完全失控的状态。 粘附是肿瘤转移过程中的一个关键环节 肿瘤侵袭的第一步是肿瘤细胞的粘附分子发生变化,结果赋予肿瘤转移的能力。换句话,就是在肿瘤转...

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Stress May Naturally Make Stem Cells of Mature Cells

压力能刺激成熟细胞产生干细胞? 2015/07/06 NovoPro 通常人们认为人的成熟细胞在自然环境中没有去分化成干细胞的能力,但哈佛大学的Jayara Rajagopal教授近期让人大吃一惊的发现:在受压力或者损伤的情况下,哺乳动物的普通成熟细胞可以去分化成全能性的干细胞。 三篇强有力的相关研究文章发表在这几周的Nature上面。来自日本Riken研究所和哈佛学者们报道了新生的小鼠脾脏细胞在“酸浴”(在培养皿中加入咖啡弱酸)的压力下发生了去分化,形成了干...

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PI3K/Akt/mToR信号通路在肾细胞癌中的研究进展

作者:李文超 ,陈军宝,卢宏柱 肾细胞癌是世界十大致死癌症之一,在我国泌尿系肿瘤 中发病率仅次于膀胱癌。研究发现,肾癌患者中30%发生转 移,另有30%在10年内有发生转移的危险,并且转移性肾癌 对放化疗及系统性治疗具有较高的耐受性 。磷脂酰肌醇 3一激酶/蛋白激酶B/雷帕霉素靶蛋白(phosphatidylin0sitol 3一 kinase/protein kinase B/mammalian target of rapamycin,PI3K/ Akt/mTOR)信号通路是细胞内重要的信号...

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mTOR信号通路与肿瘤研究进展

作者:陆建国综述,俞松 哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)是1991年从酵 母中分离出的一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,是多条信号 通路的关键蛋白分子,在体内参与多种细胞增殖、分化、 自噬、凋亡及周期调控,是近年来在肿瘤领域的研究热 点并已取得很大进展。本文就其与常见肿瘤的关系作一 综述。 1 mTOR及其信号通路? 1.1 mTOR mTOR属于磷脂酰肌醇激酶相关激酶 (PIKK)家族,是PI3K/Akt信号通路下游重要的效应分 子.根据与其结合的物质不同在体内主要以两种高度同 源(70%)的复...

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